寻常疣和扁平疣都是由人乳头状瘤病毒感染所致皮肤病，主要区别在于表现不同。
寻常疣和扁平疣均有不同程度的临床瘙痒或烧灼反应，前者以皮肤出现大小不等的圆形或椭圆形浅表性损害为主，而后者则多表现为丘疱疹及斑块等皮损，二者的主要区别在于表现不同，寻常疣以相对凸起为特征，表面较硬、角化较明显的丘疹。
可应用药物、冷冻、电灼疗法、激光等手段治疗。
扁平疣和尖锐湿疣有明显区别，两者病原体都是人乳头状瘤病毒，但是一种是性生活传染病，另外一种是单纯的接触感染。扁平疣在临床相对比较多，在手的位置会起小的米粒丘疹。一般没有其不适，会慢慢恢复。而尖锐湿疣，巨大传染性。第一个就是根据外观来进行区分。还有第二个就是根据这个人乳头状瘤病毒的全套分析，一般扁平疣就是第三和第五两个亚型感染引起的。
这两种病的病因不同，扁平疣是人体免疫力低下时受到人类乳头瘤病毒HPV3和HPV5感染引起的皮肤表面良性赘生物。而痤疮青春痘是毛囊皮脂腺的慢性炎症性皮肤病，由于毛囊皮脂腺导管被角质物堵塞，皮脂排出不畅，引起的毛囊、皮脂腺慢性炎症，以及由于原本的炎症发生继发感染引起的毛囊炎。
扁平疣是用激光治疗，还是用冷冻治疗，需要根据扁平疣皮损的临床表现而定。如果扁平疣疣体数量多，散在，疣体小，针头大小至绿豆大小选用激光治疗效果会比较好。如果扁平疣面积较大，有甲盖大小，甚至更大，很多扁平疣融合在一起，疣体又比较集中冷冻治疗会比较好。
孕妇怀孕时患有扁平疣，是不会遗传给孩子的，扁平疣是临床皮肤科常见的一种疾病，主要是由于身体抵抗力低感染了病毒发病的，主要通过接触传播传染，没有必要因为这个担心。可以采取激光，冷冻或手术等方法治疗，对胎儿是没有影响的。
