小儿凌晨咳嗽具体处理方式要看导致咳嗽的原因。
小儿咳嗽是很常见的，有的咳嗽时间段明显，有不分时间段，一天中任何时间段都可能咳嗽。若小儿凌晨咳嗽是喝水呛入气管导致的，轻拍背部咳嗽会慢慢缓解。若是房间空气过度干燥，给孩子适当喝点温开水咳嗽的症状也会缓解。另外常见的是呼吸道感染，加上夜间是小儿肺排毒时间，此时分泌物就会增加，针对这类咳嗽症状加重要进行适当的抗感染、止咳、化痰等治疗。
凌晨咳嗽有可能是由冷气刺激造成。如果是因为感冒引起的咳嗽，那么早晨起床后就会有冷空气进入气道或者是喉咙引起。最常见的是老慢支，也就是老人的支气管炎。其特征就是半夜咳嗽，因为慢性支气管炎一夜没睡，气道里面就会出现炎症，会分泌出分泌物。这种分泌物在半夜最多，而且还会有很多的唾液，在这种情况下，会引起更大的咳嗽。还有就是是支气管哮喘，咳嗽变异性哮喘的特征就是清晨咳嗽，这是由于清晨迷走神经的张力增加，导致气道收缩，导致咳嗽。
咳嗽总是不好的原因有很多，可能是出现了一些疾病，比如呼吸系统疾病或者过敏性，一些因素导致的。如果咳嗽一直不减好转，就需要及时的到医院做针对性的检查，查出病因后再进行治疗，就可以让疾病快速的好转。可以到医院做胸部CT检查或者心电图等一系列的检查，平时也要多喝一些冰糖雪梨水，不吃新鲜的水果蔬菜，会对咳嗽产生有利影响。
凌晨咳嗽厉害，首先需要考虑的是咳嗽变异性哮喘引起的，咳嗽变异性哮喘的典型表现就是发作性干咳，常发生在半夜或者凌晨。治疗上主要以吸入性糖皮质激素为首选。
凌晨出现咳嗽的情状，很有可能是哮喘引起的，也就是咳嗽变异性哮喘，往往是由于气道高反应造成的。在夜间的时候，人体迷走神经容易发生兴奋的现象，导致支气管平滑肌痉挛，从而出现支气管收缩，容易诱发咳嗽的出现。
