一般情况下，皮下囊肿不做手术是无法治愈的，所以，患者一旦诊断为皮下囊肿，最好进行手术切除。
手术前要留意囊肿的范围，并进行明确的标记，医生会将其滑膜刮除，使内壁新鲜且紧密接触，消灭残腔，防止病情出现复发。患者需要特别注意的是，囊肿表面皮肤切口禁止用肾上腺素盐水止血，因为囊肿表面皮肤薄，剥脱范围广，容易坏死。
患者出院后应该注意饮食搭配，少吃辛辣刺激的食物，保持充足的睡眠，少熬夜。
对于皮下囊肿，需要进行外科治疗，如果是皮下囊肿比较小，可以先进行保守治疗，不需要进行治疗。
皮下囊肿一般有皮脂腺囊肿和皮样囊肿两种类型，一旦发生感染，需要手术治疗。另外，由于炎症引起的肿物与周围的界限不清楚，应积极进行抗感染治疗，待感染得到控制后，再进行外科切除。有些皮下囊肿与局部皮肤有很大的联系，要将其连同局部皮肤一起切除，以免再次复发，因此治疗皮下囊肿的方式主要是手术。保守治疗只能暂时观察，一旦病情发展到一定程度，就要进行外科手术，以免肿物生长太大，导致局部皮肤缺损较大，需要进行植皮。
腋窝皮下囊肿吃药能消。服用抗生素药物如红霉素、米诺环素等。在中医方面，可用中药藏红花、乳香、没药、穿山甲等做成的贴剂，贴在患处，并吃一些清热解毒、活血化瘀、消肿溃坚的中草药。
皮下囊肿可能会癌变，但概率极小。
如果皮下囊肿患者有囊性畸形，那么恶性的可能性较大，一般都是良性的。皮下囊肿切除后需要做好组织切片检查，主要是皮脂腺囊肿，皮样囊肿，皮样囊肿等。通常情况下，头部、面部、筋、躯干等都需要外科手术，如果不是感染或者囊肿，可以完全切除。局部皮肤要不要切掉，要看与周边的肌肤情况。当然，部分缺损的皮肤是可以避免再次出现的，这要看其体积，如果是比较大的，可以尽可能的保存周边的肌肤。
皮下囊肿以青年时期头面，臂，背部发病多见.皮表可见开口小孔，推动囊肿时，此处与皮肤粘连甚紧，并见略微凹陷而出现小坑，即为直接通达皮肤表面的腺体所在导管开口，我认为应该先控制炎症等炎症控制后可以手术切掉口服抗生素疗效不佳也可静脉给药，如果实在疼痛难忍可以直接去切开引流排脓引流后再抗感染治疗。
胸前皮下囊肿可能是炎症引起的，属于良性病变，可以用芒硝热敷，不要吃上火的食物，多吃土豆、豆芽、黄瓜、桔子、苹果等补充各种维生素，不要用力揉捏局部的皮肤，定期做彩超复查，保持心情愉悦。
