小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
婴儿水样腹泻被认为是由消化不良或腹部感冒引起的。治疗消化不良的药物可用于治疗。此外，还要注意妈妈的饮食。选择易消化的食物，而不是生冷的食物。增加营养有助于调节婴儿的状况。多喝水。防止脱水。
新生儿如果出现腹胀，同时又拉肚子，家长朋友直接带着宝宝到医院找专科的医生进行治疗。因为在宝宝出现腹胀的情况下，如果同时合并腹泻，我们可能考虑这个宝宝存在肠炎。对于新生儿来说，他的肠道非常薄且娇嫩，如果出现肠炎，病情进展较快，有时过久的观察或者在家里治疗起不到作用，反而会耽误宝宝的治疗。
婴儿腹泻推拿的方法是按揉宝宝的足三里，以膝盖髌骨下方的凸起处为起点，向下四指宽胫骨外侧，用大拇指的指肚按揉这一点100-200下。也可以把手掌摊开，放在宝宝的腹部，逆时针轻揉50下左右，但一定要逆时针揉腹，顺时针揉腹则是调理便秘的。还可以让宝宝平躺在床上，用一手的食指、中指、无名指并拢，用三指指腹在宝宝腹部绕圈按摩。以腕关节连同前臂作顺时针或逆时针方向环形移动摩擦，每次3-5分钟。
宝宝拉肚子一般需要一周左右才会好。
宝宝拉肚子的临床表现分为轻度、中度和重度。轻度低热，大便次数多，一天5-8次；中度儿童一天大便次数可达10次以上，大便呈水样或蛋花汤样便，粪便中有粘液、脓血、恶心、呕吐等症状；重度患儿每日大便次数超过15次，表现为水样便，出现恶心、呕吐、发热等症状，严重脱水时会出现精神变差、烦躁不安、小便量少、口渴、全身中毒等症状。
