乙脑疫苗包括乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗两种，两种疫苗的接种时间是有区别的。首先是乙脑灭活疫苗是国家规定基础免疫共注射两针，出生后满6个月的婴儿，开始接种第一针，7到10天后接种第二针，一岁半到两岁左右，以及四岁的时候，各加强一针，六岁的时候再加强一针。其次是乙脑减毒活疫苗是1岁的时候接种第一针，2岁时加强免疫一针，7岁时再加强免疫一针。
流脑是由于细菌感染的脑膜炎症，乙脑是由于病毒感染的脑实质的病变，也就是大脑炎。两种疾病所使用的药物是明显不同的，流脑通过自己的治疗，会完全康复的，大脑炎的病症比较严重，通过治疗部分患者，未留有后遗症状。
癫痫不可以接种乙脑、流脑、白破这类的疫苗。癫痫是大脑皮层异常放电所致的临床综合征，其临床表现特点为发作性、短暂性、重复性和刻板性。癫痫是神经系统的常见疾病，癫痫不是一个独立的疾病，而是一组疾病或综合征。
接种乙脑疫苗几乎没有什么副反应，个别的孩子会出现两天以内的轻微的发热的症状，均在38℃以下。此外七岁以上的孩子儿童如果是需要加强接种的时候，接种的部位可能会出现红肿，偶尔也有血管性的水肿和过敏性的休克，发生在注射后的10-30分钟。
脑膜炎双球菌疫苗就是流脑疫苗，并不是乙脑疫苗，不能混为一谈，其实乙脑也就是们所俗称的流行性乙型脑炎。注射流脑疫苗是为了预防流行性脑脊髓膜炎。所以脑膜炎双球菌是流脑。
乙脑疫苗比较安全，仅有少数小儿会出现不良反应。注射乙脑疫苗后可出现发热，还可出现头痛、头晕、乏力、寒战等全身症状，也可出现腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道症状，一般在1天内可自然消退。注射乙肝疫苗后还可出现局部不良反应，如注射部位发红、肿胀、出现疼痛、皮温升高等，局部的不良反应一般持续数个小时。
