过敏性结肠炎可以根据病情使用抗过敏药物控制，另外根据临床症状对症治疗。此外可以做一下过敏原实验检查，根据检查选择治疗。过敏性结肠炎不是肠易激综合症，该病于神经功能失调有关，可以到正规医院或三级甲等医院就诊检查治疗。
过敏性肠炎会引起肠道功能不全引起消化不良，导致腹痛、腹泻等症状，建议根据宝宝体质，可使用一些抗过敏的药物，平时注意饮食卫生。常喝温水，多吃水果蔬菜，母乳，忌食辛辣刺激生冷的食物。
孩子出现过敏性肠炎，一般是由于过敏体质引起的。这种疾病主要表现为皮肤出现红点，伴有明显的皮肤瘙痒症状，拉肚子，恶心呕吐症状。要注意避免接触过敏性物质，不要吃容易过敏的食物，防止出现不良反应。
新生儿过敏性肠炎轻者表现为便血、腹泻、腹痛、腹胀、呕吐等消化道症状。严重者可以发生营养不良、低蛋白血症、贫血等。可以先做消化内科检查。检查过敏原，有针对性的避免接触过敏原，就是调理肠胃。可以给孩子服用腹泻奶粉。
如果患上过敏性肠炎，应当先去一家医院去做抽血过敏原lge检测，很多婴幼儿，在初期饮用奶粉的时候，有可能会造成肠胃方面的不适，导致肚子不舒服、腹泻呕吐，粪便中带血等，有的时候会随着血流运送到周身每个地方各个器官部位，同时产生不同器官的过敏反应。
用抗生素治疗无效，应补足液体和用中药治疗。给患儿喂适量小苏打、精盐葡萄糖水。还应控制饮食，重者禁食6~12小时，以后逐渐由少到多，由稀到稠。预防秋冬季腹泻，应注意婴儿喂养卫生，用过的奶瓶奶头用开水烫泡，大人喂小孩之前应洗手，幼儿饭前便后要洗手，不吃不洁和变质食物。
