生理性腹泻的原因是由于母乳内所含的某种营养成分，如蛋白质或脂肪，超过婴儿的需要，超过婴儿的消化吸收功能，而婴儿的消化能力发育健全，所引起的腹泻。此阶段的孩子常常会出现大便次数偏多，质地也比较偏稀，但是孩子的精神状态比较好，吃东西也正常且玩耍照旧。
新生儿生理性腹泻主要见于6个月以下的孩子，此阶段的孩子常常会出现大便次数偏多，质地也比较偏稀，但是孩子的精神状态比较好。大多是母乳喂养的孩子，主要由于孩子对妈妈母乳中的乳糖不耐受所致。
引起母乳生理性腹泻的原因有：
1.母乳中含有大量的前列腺素，这种激素可以促进儿童小肠平滑肌的运动，增加水分和电解质，造成大便稀；一日两次
2.由于小儿乳糖不耐症，小儿由于乳糖酶不足，对乳糖的耐受性较差，容易造成腹泻。
另外，还会出现由母乳导致的生理性腹泻，多数儿童的外表看起来比较胖，可能会出现轻微的湿疹，宝宝的大便次数会增加，但是不会影响到宝。
通常来说，总是拉稀可能是饮食不当、肠胃虚弱等原因导致的。
如果不注意卫生，经常吃不干净的食物、吃辛辣油腻的食物，可能会导致总是拉稀，如果存在肠胃虚弱的情况，也可能会导致的肠胃功能失调，从而导致总是拉稀。建议到正规的医院进行肠镜检查，以确定是否有器质性的疾病。日常生活中要注意饮食，避免食用生冷寒凉辛辣刺激的食品。
生理性腹泻多见于一些婴儿，母乳喂养的孩子居多。一般母乳喂养的孩子大便次数多并且稀，这是正常现象，有可能就是生理性的腹泻。这种小孩一般都见于虚胖的小孩，可能会有湿疹等原因。但是这种不耽误孩子生长发育的情况，就叫生理性腹泻。
