宝宝打乙肝疫苗不良反应比较少见，少部分宝宝会出现接种部位红肿热痛、硬结，长皮疹。有些会出现头晕、头痛、发热、寒战、恶心、呕吐、乏力、烦躁、嗜睡等症，反应多在接种后2-3天自然消失。
根据实际的情况，乙型肝炎疫苗是非常安全的，一般不会产生不良的反应。
一小部分患者接种完疫苗，会在接种点红肿、硬结，也会有少量的患者会有红肿、硬结等症状，也会有少量的发热症状。乙肝接种后会有明显的过敏性反应，但是通常情况下是没有任何副作用的。副作用很小，属于自限性，需要注意的是要注意的事项。要避免吃辛辣、刺激的食物。
通常情况下，宝宝打乙肝疫苗不良反应为接种部位红肿、发烧等。
乙肝疫苗是基因重组乙肝疫苗，接种反应小，一般表现为宝宝接种部位出现红肿，以及微小的硬块，一般24-48小时后即可消除，无须处理。但如果宝宝注射之前，免疫状态低，有可能会引起局部出现较大的红、肿、热、痛的症状，还可能会发烧。如果宝宝出现发烧的情况，不超过38.5度，一般3天之内能够自行痊愈。但如果反复超过38.5度超过在3天以上，建议去小儿内科面诊治疗。
注射乙肝疫苗的婴儿，由于身体差异，少数婴儿会出现头晕、头痛、发热、寒战、恶心、呕吐、疲劳、易怒、困倦、皮疹、手臂酸酸或注射部位肿胀、发热、硬化等类似于一般疫苗接种的轻微症状，一般会缓解。
只有少数人出现接种部位红肿、硬结、疼痛，手臂酸重或发热、恶心、呕吐、乏力、皮疹等与疫苗接种大致相仿的轻微反应，多在1～3天内不治自愈。如果患急性传染病或其他慢性疾病不能接种乙肝疫苗患有皮炎、化脓性皮肤病、严重湿疹的小儿不宜乙肝疫苗接种。
乙肝疫苗和卡介苗能分开打，不在同一个胳膊。一定要分开手臂进行接种，通常是乙肝疫苗接种在右手，另一个接种左手，如果由于某些原因没能接种，乙肝疫苗接种在先，那就2周后再接种；如果后一个接种在先，那要1个月后再接种乙肝疫苗。
