肛瘘外口闭合后是否要戳破，主要取决于肛瘘者自身的症状，和外口的局部情况。假如肛瘘外口闭合后，而肛瘘处于静止期，无明显的肿痛，溢脓的症状，外口闭合后可以不需要特殊的处理。伴有肛旁肿痛不适，局部红肿，炎症比较明显，考虑肛瘘伴感染的症状，对于外口闭合的，及时把外口切开，让脓性分泌物排出，避免肛瘘感染进一步加重，形成肛周脓肿。
内口的处理可以每天按压肛门挤出里面的脓水，别让脓水聚在里面，可以口服抗炎药物治疗，每天在指导下可以坐浴治疗，让内口慢慢长好，不要吃辛辣刺激的食物。平时注意饮食，注意自身的营养均衡。
如果已经出现肛瘘，那么需要通过手术来治疗了，出现凸起也有可能是痔疮，具体是什么情况需要做个肛检来确定，如果确定肛瘘，瘘外口流出少量脓性、血性、粘液性分泌物为主要症状。手术治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。
肛瘘手术常用的治疗方法是挂线治疗，大致的方法是沿着路管植入一根丝线，通过收紧丝线的方法，使得瘘管被破坏了。平时注意保持局部的清洁卫生，保持大便通畅，排便后及时清洗肛门。
肛瘘手术，如果是单纯性肛瘘，瘘管较直，手术较为简单，直接将瘘管切开即可，手术时间约5-10分钟。如果瘘管弯曲，内口较多，为复杂性肛瘘，多需沿内口切除肛瘘，沿肛瘘管道寻至内口，手术较为复杂。
肛瘘是肛肠科比较常见比较严重的疾病。经久不愈会越来越严重，最终发展成癌症。需要及时的认真的对待疾病，早发现早治疗，肛瘘的内口是初起感染生成肛瘘的入口，是发病的起源，因此，肛瘘都有其内口，同时，瘘管长期不能愈合，充分证明有病灶内口的存在。需要手术治疗。
