巨细胞病毒感染，可应用各种抗病毒制剂如GCV、抗巨细胞病毒的免疫球蛋白制剂、干扰素及转移因子等来治疗，在治疗之后也要注意预防。平时也要注意有意识的身体素质的锻炼，提高机体免疫力，预防病毒感染，要注意卫生环境，饮食环境，饮食方面建议以清淡营养为主。
最主要就是使用抗病毒的药物，比如更昔洛韦或者使用抗病毒的免疫球蛋白制剂以及干扰素转移因子等。丙氧鸟苷有防止巨细胞病毒扩散的作用，如果与高滴度的抗巨细胞病毒免疫球蛋白合用，可以降低骨髓移植的巨细胞病毒肺炎并发症死亡率。
巨细胞病毒感染一般不需要进行治疗，需要密切观察。如果需要治疗，常见如下：
1.症状较重的病人，如果出现了神经系统症状、肺炎、肝炎等疾病，可以口服更昔洛韦、膦甲酸钠等药物。
2.抗病毒疗法：最好的治疗方法是更昔洛韦，但是它的生物利用度很低，需要静脉注射。缬更昔洛韦是缬氨酸更昔洛韦的先驱物，其口服后的生物利用度得到了极大的提升，具有很好的抗病毒效果。
3.对于患者治疗不建议采用预防性的方法，但必须严密监控，一旦CMV-DNA阳性，缬更昔洛韦可尽早进行预防性治疗，以减少患者的感染。
妊娠合并巨细胞病毒感染通常主要使用抗病毒药物治疗。
感染后建议去正规三甲医院就诊，在医生指导下使用对胎儿影响小的药物，一般最少需要治疗3-6个月，治疗期间定期复查指标，如果结果显示阳性要继续治疗。为防止用药影响胎儿发育，要做好产前检查，尤其16-20周的唐氏筛查和22-26周的四维彩超排畸检查，如果出现异常情况，根据医生建议终止妊娠。
注意均衡营养饮食，保持心情舒畅。
不能自愈的。巨细胞病毒感染症是由巨细胞病毒（CMV）引起的先天性或后天性感染。感染巨细胞病毒后的临床表现和转归与个体的免疫功能状态密切相关。免疫功能正常者因密切接触感染者的分泌物而感染。积极抗病毒治疗，防止各种并发症的发生。
新生儿巨细胞病毒感染可以治疗，新生儿的免疫力、身体的自愈能力都是比较弱的，就算自身的疾病病情比较轻，也不一定能够自行恢复，需要进行治疗。新生儿会出现巨细胞病毒感染，是因为巨细胞病毒可以通过在胎儿期的胎盘传染，或者孩子出生以后，经过妈妈的产道或者母乳分泌病毒而感染。