小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
感染性原因：需考虑是否是秋季腹泻、轮状病毒或新病毒感染引起，细菌性原因：如细菌性痢疾感染，包括伤寒、沙门菌感染等。过敏性因素：如对奶粉蛋白质过敏，会表现为腹泻，伴有湿疹的情况。如给予止泻处理，腹泻症状改善不明显，需进行过敏检测。
婴幼儿腹泻，还可以继续哺乳和进食，但是此期间不能换新的奶粉或者乳制品，不能添加新的辅食。如果孩子腹泻的话，可以口服蒙脱石散和妈咪爱进行治疗，适当多饮水。
预防宝宝腹泻，平时要注意卫生。饭前、便后要洗手；注意饮食卫生，饮食要多样化，食品如有异样或异味应立即弃用，切不可食用。如果周围有腹泻的人，要尽量避免接触，并注意防护，以防被传染。
宝宝腹泻的原因：细菌、病毒、寄生虫等病原体的感染。一次或长期超量喂食造成婴幼儿胃肠道负担过重，以致食物在胃肠内消化吸收障碍而出现的腹泻。感冒或泌尿道发炎也会引起腹泻。
秋季性腹泻不一定先出现呕吐，再出现腹泻的，有的时候有可能单独出现腹泻，有人有可能会先出现腹泻的。所以并不是先出现呕吐再拉肚子的，每个人的具体情况不一样，得了这个病应当尽快去医院进行医治，平时要注意饮食清淡，不要吃过凉辛辣的食物，多吃一些水果蔬菜，这样对病情有好处。