甲硝唑主要用于治疗厌氧的细菌引起的口腔、腹腔、女性生殖系统、下呼吸道、骨骼、关节等部位的感染，还可以和其他药物合用，预防妇科手术、胃肠外科手术时的厌氧菌感染。甲硝唑还用来治疗阴道毛滴虫引起的阴道炎、尿道炎、前列腺炎，肠道内和肠道外阿米巴病，麦地那龙线虫病，小袋虫病，贾第鞭毛虫病等寄生虫病。
药流是安全的。怀孕49天以内就可以去医院做药物流产的治疗的。可以在当地医生指导下服用米非司酮，进行药物流产就可以，在治疗期间一定要注意休息，加强营养，注意会阴部卫生清洁，勤换内裤，近期不能过性生活。
如果没有不适，可以不用特殊的处理。注意同房后一个月去医院复查妇科彩超，如果彩超证明没有怀孕，没有不舒服，就没有什么要注意的事项。如果彩超证明怀孕了，就要考虑是否要这个宝宝，要注意休息，避免过度劳累，注意禁止性生活。
服药期间宜定期检查血象。孕妇肝功能异常、外周血白细胞数偏低者应慎用。对诊断的干扰：甲巯咪唑可使凝血酶原时间延长，并使血清碱性磷酸酶、门冬氨酸氨基转移酶(AST)和丙氨酸氨基转移酶(ALT)增高。还可能引起血胆红素及血乳酸脱氢酶升高。
念珠菌性阴道炎表现为，外阴明显搔痒，伴灼痛，白带增多呈凝乳样或豆腐渣样。镜下可见假菌丝和芽苞。体征：外阴红肿，可见抓痕。阴道壁见白膜，搽去白膜可见红肿的粘膜面。治疗一般是局部使用抗真菌的药。
此类药物主要用于肠炎、心内膜炎、急性支气管炎、慢性支气管炎、淋病、骨髓炎、小儿腹泻、败血症、消化疾病、心血管疾病、神经疾病。对非产酶金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、克雷伯菌属、沙门菌属、变形杆菌属、摩根菌属、志贺菌属等肠杆菌科细菌均有良好的抗菌作用。
