要进行全身抗炎治疗，建议口服头孢类抗生素，加甲硝唑类药物，可以控制炎症，局部消毒以后把脓肿切开引流。引出脓肿内的脓汁，这样可以明显缓解疼痛，还使得炎症得到进一步的控制。
肛周脓肿是肛周感染的后期症状，肛周脓肿如果没有得到有效的控制就是肛瘘.如果肛周脓肿的脓包不大，皮肤能代谢下去，一般不会发展成肛瘘.如果肛周脓肿包很大，而且出脓头，破脓了，70％的人结果都是肛瘘.肛瘘只有开刀了。
盆腔脓肿的治疗方法是比较多的，保守治疗效果不好的情况下，通过手术的方法进行调理，盆腔脓肿的吸收的方式是比较多的，出现了比较轻微的盆腔脓肿的现象，通过妇科检查的方法来辅助调理病情，通过使用补充液体的方法辅助吸收。
盆腔脓肿最好将后穹窿切开，盆腔脓肿给予引流达到目的。并且切开时将脓液送化验，做细菌培养加药物敏感试验，根据结果给予抗生素治疗。结果没出来前，需要使用抗生素治疗。
及时的进行手术切开，充分引流，将脓汁排出之后，疼痛或者发热的症状也能够得到缓解，同时也应该系统的进行静脉抗感染治疗。肛周脓肿，表现为局部流脓，考虑是局部软组织感染、坏死、破溃。
肛周脓肿严重了应抽脓减压局部消毒，可暂时减轻脓腔张力，缓解疼痛，适用于临时应急处理，但不能代替手术，为进一步减少手术创伤，可采取双向等压引流手术治疗，术中采取半切割挂线，并放置引流管，可不切断肛直环而使脓腔愈合。
