一般情况下，肥厚性心肌病首选β受体阻断剂比如美托洛尔、比索洛尔、拉贝洛。
此外，也可以用非二氢吡啶类钙拮抗剂以及ACEI或ARB类的药物来治疗。尔等，通过负性肌力及减慢心率作用，增加心脏回心血量，如果梗阻型肥厚型心肌病合并有心律失常，易导致猝死或卒中，可以加用抗凝药如利伐沙斑等。禁用硝酸甘油及洋地黄类药物。
肥厚性心肌病一般不会引起晚上血压高。
肥胖性心肌病主要包括肥厚性非阻塞性心肌病，一般不会对血压造成任何的伤害，而肥胖性心肌病与肥胖性心肌病无关。肥胖性心肌病并不会造成晚间的血压高，除非是心力衰竭，或者是心脏疾病较重，否则会造成血压增高。还有就是肥厚性阻塞性心肌病，肥厚性阻塞性心肌病，其心脏的射血功能会受到很大的影响，从而引起周围血液容量的下降，从而引起血压下降，因此并不会引起高血压，但是夜间血压高要注意是由于原发性高血压没有得到有效的治疗。
目前临床上缺少肥厚性心肌病的专用药物。
贝塔阻滞剂是首选的一线用药，如果患者不能耐受贝塔组织剂，或者有禁忌，可以选择钙离子拮抗剂。如果是肥厚型梗阻性心肌病，钙离子拮抗剂会增加流出道阻塞，尤其是在心功能不全时，可以服用洋地黄制剂和利尿剂，可以增强心肌收缩能力，降低血容量，增加心室梗阻，如果心塞时有快速十率的房颤，可以选择洋地黄，也可以选择利尿药物，同时要注意缓解肺淤血，配合贝塔受体阻滞剂、钙拮抗剂等。
治疗肥厚性心肌病的药物可以找针对流出道梗阻的药物进行治疗，药物治疗是治疗肥厚性心肌病的基础治疗方式。肥厚性心肌病是遗传性心肌病的一种类型，以心肌肥厚为主要诊断依据。肥厚性心肌病病人会出现呼吸困难，胸痛，心律失常，晕厥等。
肥厚性心肌病一般主要表现有呼吸困难、晕厥、心绞痛等症状。
肥厚性心肌病是一种原发性心肌病，检查时能够在心尖、胸骨左等部位，或者在第三、四肋间听得到粗糙的、收缩期的喷射样杂音。肥厚性心肌病发病一般可呈家族性或者散发性。大多数患者治愈后效果比较好，但如果患者出现左室流出道的梗阻，那会增加发生猝死的可能性。
出现不适时建议及时就医。