肾囊肿是否会引起腰疼，要看囊肿的部位、大小和数量。囊肿直径小于五厘米的情况不会有任何感觉和不适。若囊肿直径比较大，会产生疼痛，如是合并感染，会因为感染出现发热胀痛的情况。
卵巢囊肿是有可能引起腰痛的，也有可能腰痛是卵巢囊肿的主要症状。出现腰痛要及时治疗，也可以复查一下囊肿的情况，同时还要警惕是否有其他妇科炎症，或是腰肌劳损等引起的腰酸痛。
肝囊肿一般不会有症状的，出现的腰疼症状，并不是因为肝囊肿引起，肝囊肿只要不是非常巨大，并不需要做特殊的治疗，定期复查就行了，而出现腰部的疼痛症状，考可能与劳损或者受凉有关，可以进行热敷以及按摩处理，另外可以适量活动锻炼。
卵巢囊肿是常见的生殖系统肿瘤，有多种形态，可以有囊性或者囊实性的，也有一定的恶性比例。如果良性，一般症状不明显。如果因炎症引起的囊肿，或者恶性的可以出现疼痛等表现。可以做超声，腹腔镜等检查。卵巢囊肿可以采取手术切除治疗。
可以手术取石，也可以观察，就是多喝水，多排尿，半年左右复查泌尿系彩超一次，看看结石是否已经排出或者又已经长大。如果是特殊职业，不能有这个结石，只能手术，得做输尿管软镜手术，因为这么小的结石只能输尿管软镜才能碎石取石。
肾囊肿是成年人肾脏最常见的一种结构异常，单纯肾囊肿一般没有症状，只有当囊肿压迫引起血管闭塞或尿路梗阻时可出现相应表现，有可能对肾功能产生影响。囊肿体积较小，但是有腰痛症状，建议去医院复查一下，如果体积增大，可以囊液抽吸术并囊内注射硬化剂或行手术治疗，没有特别有效的药物对于肾内囊肿治疗。
