一般情况下，艾灸肛门对直肠炎的治疗，能达到辅助治疗的效果。
直肠炎多由肠道内菌群失调、有害菌滋生引起，而艾炙通常无杀菌、消炎之功效，故艾灸无法直接用于直肠炎，只能起到辅助治疗的作用。直肠炎以药物治疗为主，在平时要注意生活作息规律，尽量不吃辛辣刺激性食物，不要滥用抗生素，以免对肠道正常菌群造成损害，这样才能控制直肠炎病情。
直肠炎的治疗有灌肠，对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。可以通过粪便、涂片或活检组织进行细菌、真菌和病毒检测；相关抗体及毒素测定。要注意休息和饮食。
直肠炎治疗一般要一周到半个月。但是这种疾病容易复发，稍有不注意饮食，就会前功尽废。很多病人就是这样反反复复的。所以，注意饮食尤为重要，合理膳食，适量运动，戒烟限酒，心理平衡，还有防止受凉，按时作息都是需要遵守的。
直肠炎反复患者可以口服氧氟沙星、甲硝唑、奥硝唑等药物治疗。
直肠炎患者除了要积极配合医生治疗以外，平时要养成良好的饮食习惯，注意饮食卫生，戒烟戒酒，避免浓茶浓咖啡，不能吃辛辣刺激性食物，注意腹部保暖。治疗期间患者要注意多休息，同时坚持清淡饮食，不要吃辛辣刺激性食物，比如火锅、冰可乐等，有利于身体恢复。
直肠炎的治疗原则有以下几点：中药治疗，应以健脾补肾，益气除湿为治本之法，清热解毒，活血化瘀为治标之用，辨证施治。西药治疗，根据病人炎症明显时可短期使用抗生素配合其他的药物调节肠道功能，需要在医生的指导下进行心理治疗。心理治疗，该病多伴有焦虑，抑郁，紧张，多疑等精神心理改变。
一般情况下，直肠炎患者建议及时就诊，明确病因后，对症治疗。比如细菌感染造成的感染型直肠炎，就需要用抗生素治疗等。具体分析如下：
通常来讲，对于细菌感染造成的感染型直肠炎患者，通常需要用左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素进行治疗。需注意的是，患者用药之前需要做药敏试验。除此之外，还有部分患者是因为便秘、长期大便嵌顿引起的压迫性直肠炎，此时就需要先改善便秘的症状，患者除调整饮食结构外，可以服用乳果糖。需注意的是，所有药物要在医生指导下服用。
