遗传因素、人类遗传缺陷或突变可形成颅内肿瘤。多发性神经纤维瘤是神经系统肿瘤最典型的遗传。是常染色体显性遗传肿瘤。大约一半的病人有家族史。化学因素也是导致脑肿瘤的原因。
甲减具有某种遗传性，家族中的某人患甲状腺功能减退症时，然后很可能会遗传到孩子，导致孩子有甲减症状。
因此，对于儿童来说，应该注意自己是否存在甲减病，以便及时治疗。若孩子甲状腺激素缺乏分泌，表现为食欲减退或粘液性水肿、虚弱。就可以诊断为甲减，而不是因为其临床表现所引起。亦为患甲减之反映，还可能与孩子免疫能力相关。
儿童脑肿瘤在相当程度上与胚胎组织的残余有关，例如表皮样囊肿，畸胎瘤，颅咽管瘤，新生儿的脉络丛乳头状瘤等都与胚胎组织的残留有关系。除此之外，神经母细胞瘤，神经纤维瘤病等与遗传因素有关。此外，基因突变，癌基因和抑癌基因的异常表达也与儿童脑肿瘤的发生有一些关系。某些具有致癌作用的化学物质，致瘤病毒和放射线等，也与儿童脑肿瘤的发生有一些关系。
一般情况下，小儿童得白血病的发病原因还不清楚，国内外相关学者均表示，与各种原因相关。导致白血病的特定原因有：感染因素：最常见的是病毒感染和细菌感染；环境因素：空气污染、水污染、食品污染、装修材料污染、电离辐射污染等。基因方面：患有先天性疾病的孩子，就像是一对双胞胎，如果一个患上了白血病，那么另一个患上了20%到25%的白血病，而21-三体综合症的孩子，患上了白血病的可能性是普通孩子的2-4倍。
儿童会得糖尿病一般与遗传因素和环境因素共同作用、营养过剩等因素有关，具体内容如下：
1型糖尿病是儿童最常见的糖尿病类型，但其发病率较低，应低于5%。1型糖尿病主要是一种自身免疫性疾病。遗传因素和环境因素共同作用导致胰腺免疫破坏，导致胰岛素分泌绝对不足。没有特效药治疗，只能给胰岛素维持生命。这些孩子一般都很正常或者很瘦。目前，一些儿童可能患有2型糖尿病。因为营养过剩，大量饮用碳酸饮料、含糖饮料等，会导致肥胖，而肥胖是导致儿童糖尿病的另一个原因。
在病因上还不十分清楚，但是儿童脑肿瘤在相当程度上与胚胎组织的残余有关，例如表皮样囊肿、畸胎瘤、颅咽管瘤、新生儿的脉络丛乳头状瘤等都与胚胎组织的残留有关系。
