大于6mm的肾结石，需进行手术干预或者体外碎石治疗。治疗方式需结合结石的大小位置、肾功能情况而定。如果结石合并肾脏积水、肾盏积水，或者出现腰痛症状，需进行积极的体外碎石或者手术干预治疗。
小于5mm的输尿管结石，90%成年人可自行排出体外，大于6mm的肾结石，需进行手术干预或者体外碎石治疗。要多喝水，多运动，喝水可以稀释尿液，避免形成结晶，可以避免形成结石。每天喝水一定要超过2000ml，不要吃含草酸高的食物。
一般肾结石0点6厘米以下的结石，多运动、多喝水，辅助排石药物，多数能自行排出，0点6-2厘米的结石体外碎石，2厘米以上的结石，一次碎石不干净，反复碎石可能会对肾脏造成潜在损害，一般不主张碎石治疗。
首选国家最新发明专利设备-体外震波排石机进行排石治疗；并且尽快进行早期治疗，排石效果比较好；首先说明体外震波排石机较体外冲击碎石机的原理是两种决然不同的设备，体外震波排石机的优势在于其对脏器无任何损伤，而且排石彻底，病人无痛苦。
结石小于0.6cm，光滑，无尿路梗阻、无感染，可先使用保守疗法。直径小于0.4cm，光滑的结石，90%能自行排出。超过0.6cm的结石，可以体外冲击波碎石通过X线或B超对结石进行定位，利用高能冲击波聚焦后作用于结石，使结石裂解，直至粉碎成细砂，随尿液排出体外。
肾结石可以通过以下方式使用手术治疗，具体分析如下：
目前外科手术有开刀和微创手术两种，开刀手术已经很少见了，微创手术有经皮肾镜钬激光碎石和输尿管软镜钬激光碎石。肾结石重度肾积水时，应采用经皮肾镜钬激光碎石，该方法是在腰间开一条1cm的小孔，进入肾内，用激光将结石击碎。另一种方法就是输尿管软镜钬激光碎石，这种碎石不会对人体造成任何伤害，但是碎石必须要自己排出，因为激光会将结石磨成粉末。
