细菌感染通常使用的抗生素为头孢类或青霉素类，具体视病情严重程度而定，亦可用中药消炎治疗。
细菌感染是致病菌或条件致病菌进入血循环中进行生长繁殖，产生毒素和代谢产物引起感染。如果是重症患者，用中药副作用就比较小了。如果出现发烧、咳嗽等症状，可先服用退热药。注意，平时要多喝水。感冒后，要及时服用退热药和止咳剂等药物。注意休息、不熬夜，饮食宜清淡，不吃生、冷、辣、刺激的食品，帮助身体康复。
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细菌感染通常是一定要用抗生素的。
在使用抗生素要在医师的指导下使用，不能确定是什么原因导致了菌群的紊乱，但是出现了细菌感染就必须使用抗生素，常见的抗生素有头孢拉定，头孢氨苄，红霉素，阿奇霉素，罗红霉素、头孢克圬，头孢曲松、庆大霉素，妥布霉素，阿米卡星等。有些感染，不能立即使用抗生素，会导致全身的炎症，严重的还有感染的情况。
细菌性肠炎在正常使用抗生素的情况下是不会导致小孩身体健康的。并且可以缩短病程减轻小孩，因为常肠炎腹泻导致的营养不良，及生长发育，抗生素会有一定的副作用，但很小。去医院开相关药物，病情基本可以康复，而且可以防止小孩因，腹泻导致营养不良。
抗生素治疗细菌前列腺炎前期有一定的效果，但是后期效果逐渐减小甚至消失，不能很好的治疗前列腺炎症。病人平时要注意个人卫生及性生活卫生，不要长时间的久坐，穿棉质透气的内裤。多喝白开水，这样可以通过排尿将细菌排出体外。
没有细菌感染一般是不建议吃抗生素的。
没有细菌感染时吃抗生素会增加机体对抗生素的耐药性，还会导致副作用的出现。如果出现发热、咳嗽、咳痰等症状，或者是恶心、呕吐、腹痛、腹泻等表现，或是尿频、尿急、尿痛等症状都建议去正规医院做相应的检查，比如血常规、尿常规、C反应蛋白、PCT(降钙素原)、胸部CT等来分辨是细菌还是病毒感染，然后在医生指导下给予针对性的治疗。
