一般来说，对于甲状腺功能亢进的药物，其不良反应主要有三种：
第一种情况，就是服用了药后会有皮疹，这属于一种过敏性的症状，一般会在全身和身体的不同地方都会有皮疹。
第二种是肝功异常，转氨酶增高是甲亢病人的主要症状，肝功异常、转氨酶增高等都很常见。
第三是由于服用了甲亢药物，导致白细胞减少，白细胞的总量减少后，嗜酸性粒细胞的绝对数值也会减少。
甲亢的病人是不会引起肌肉疼痛的，特别是浑身肌肉疼痛的。他巴唑也是不会引起浑身疼痛的，建议是应该测一测是不是发热的，发热是可以这样的。或者是受凉引起。也可能是颈椎病引起四肢无力疼痛。
甲亢药物的副作用是比较厉害的。甲亢药物会让一部分病人出现肝功能异常，尤其是对于长期服用丙硫氧嘧啶的病人，需要定期监测肝脏功能，有的病人甚至会出现爆发性肝功能异常或者肝衰竭。
甲亢属于超高代谢综合征，患者基础代谢率增高，蛋白质分解代谢增强，须借助营养治疗供给高热能、高蛋白、高碳水化合物、高维生素饮食，以补偿其消耗，改善全身的营养状态。增加维生素，尤其是B族维生素和维生素C、维生素D等。如有腹泻更应注意，多选用含维生素B1、维生素B2及维生素C丰富的食物，适当多食动物内脏、新鲜绿叶蔬菜，必要时补充维生素类制剂。
甲亢吃赛治的副作用通常有皮疹或皮肤瘙痒及白细胞减少；较少见严重的粒细胞缺乏症；还可能致味觉减退、恶心、呕吐、上腹部不适、关节痛、头晕头痛、脉管炎、红斑狼疮样综合征。可能罕致肝炎、间质性肺炎、肾炎和累及肾脏的血管炎。定期监测血常规、肝肾功能和甲状腺功能等。
