要进行全身抗炎治疗，建议口服头孢类抗生素，加甲硝唑类药物，可以控制炎症，局部消毒以后把脓肿切开引流。引出脓肿内的脓汁，这样可以明显缓解疼痛，还使得炎症得到进一步的控制。
主要是由于智齿冠周炎而导致的，由于颌骨的退化和牙齿退化不成比例，往往导致第三磨牙萌出位置不足而出现阻生，阻生的牙齿刺激周围的牙周组织产生炎症，称为智齿冠周炎。口服奥硝唑头孢和洛索洛芬钠改善缓解症状。
有脓液形成是可以用针刺破脓肿的。牙龈脓肿大多数是慢性牙周炎引起的，配合服用消炎药物进行治疗，要积极治疗牙周炎等原发性疾病，注意口腔卫生，清淡饮食，多吃蔬菜和水果。
首先，由于阻生齿尚未完全萌出或完全未萌出，所以在拔牙时，应先用局部麻醉切开牙龈、翻瓣、露出牙齿、去骨等一系列操作。拔牙后还要缝合牙龈。所以拔完牙之后，口腔卫生很难做好，因为伤口会翻转，牙龈也会缝合，容易造成术后肿胀、牙龈肿胀等不适。这种情况下，要注意口腔卫生，术后第二天要漱口，去除细菌，防止牙龈肿胀。
牙龈脓肿单纯的抗生素治疗效果一般，多采用中西医结合治疗。对于爆发性的患者全身疾病症状明显，除给予有效的足量抗生素外，还应用清热泻火的中药内服，如清胃汤等。
