治疗肛周脓肿需要手术，手术时间一般半个小时以内，加上麻醉等时间，从进手术室到出手术室一般一个小时左右。肛周脓肿手术过程不复杂，包括脓肿切开、寻找内口、切除或挂线等过程，这些过程所花时间都不多。
对于低危的脓肿，肛周脓肿皮下型，在1到2周的时间内能够彻底的治好。而高位的肛周脓肿需要进行挂线疗法，因为内口的位置比较深，之后也需要进行换药，恢复的时间就比较长，大概两周到三周的时间，在治疗期间应该静脉抗炎治疗，增加饮食营养，注意肛周卫生。
一般恢复期要7-13天，具体的天数还是要根据个人的情况来定。对于肛周脓肿恢复来说，早期症状疼痛减弱，肿胀也不是特被强烈，肛门周围红肿逐渐好转，主要是各个症状都比较理想，注意清洁卫生。
肛周脓肿必须手术治疗，不然将成为一个严重的问题。同时，可以选择无痛微创手术治疗。恢复期很短。同时，手术后易于护理。如果肛周脓肿手术后疼痛，可以适当使用一些止痛药，同时也可以混合一些胃保护药。肛周脓肿手术后，应注意换药治疗，定期坐浴治疗，直至脓肿浅部基本消失。
肛周脓肿不会自愈，应该考虑需要手术治疗，如果不积极治疗，肛周脓肿破溃后会形成肛瘘，这种症状也需要手术治疗。确诊肛周脓肿后，积极手术治疗，需要应用抗生素药物，手术后积极的换药，大部分都能一期愈合，保持肛门清洁。
