新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。
宝宝卡介苗什么时候打，需要根据具体的情况来判断，具体分析如下：
如果是一个正常的足月婴儿，应该在出生24个小时之内注射疫苗。若婴儿是一名具有显著的先天性缺陷或出生重量小于2500g的婴儿，或同时出现发烧、痢疾、湿疹等情况，则应暂停使用该疫苗。只有在疾病完全康复或者超过2500g的时候，才能进行卡介苗的接种。超过3个月的婴儿，不管是初种还是复种，都要进行结核菌素测试，只有在负（-）反应的情况下，才能进行疫苗注射。
乙肝疫苗和卡介苗能分开打，不在同一个胳膊。一定要分开手臂进行接种，通常是乙肝疫苗接种在右手，另一个接种左手，如果由于某些原因没能接种，乙肝疫苗接种在先，那就2周后再接种；如果后一个接种在先，那要1个月后再接种乙肝疫苗。
卡介苗的接种时间一般是在孩子出生后的24小时进行接种，对于没有接种的卡介苗宝宝，可以在3月内直接进行补种，3月-3岁需要进行PPD试验，阴性可以补种。卡介苗是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗，具有增强巨噬细胞活性，加强巨噬细胞杀灭肿瘤细胞的能力，活化T淋巴细胞，增强机体细胞免疫的功能。
有些地方新生儿出生第一针乙肝疫苗要在24小时内注射，一般小宝宝一出生，医院的护士就会抱去打此类针的。也有的是在24小时到2个月内，在当地疾病预防控制中心或社区卫生服务站，进行接种。
卡介苗和乙肝疫苗可以一起打。
卡介苗是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗。卡介苗可与乙肝疫苗同时接种，不影响彼此效果，并能改善乙肝表面抗原阳性，但应分别向左，右两侧臂进行接种。接种24小时之内切忌沐浴，注意观察皮肤的表面状况及接种后的进食和排便情况、睡着了等，如果不舒服，要与接种机构取得联系，及时咨询医生。
