以手术或者化疗作为主要的治疗手段，晚期以化疗为主。胚胎瘤生长迅速，早期就可向腹膜广泛转移，或通过淋巴道扩散到腹主动脉旁淋巴结，晚期通过血道转移至远处的器官，复发病例多在治疗后两年内死于腹腔内广泛转移，所以胚胎瘤恶性程度是非常高的，想要完全治愈是非常困难的。
儿童脑肿瘤在相当程度上与胚胎组织的残余有关，例如表皮样囊肿，畸胎瘤，颅咽管瘤，新生儿的脉络丛乳头状瘤等都与胚胎组织的残留有关系。除此之外，神经母细胞瘤，神经纤维瘤病等与遗传因素有关。此外，基因突变，癌基因和抑癌基因的异常表达也与儿童脑肿瘤的发生有一些关系。某些具有致癌作用的化学物质，致瘤病毒和放射线等，也与儿童脑肿瘤的发生有一些关系。
通常情况下，儿童肿瘤是遗传因素、免疫因素和环境因素原因引起的。具体分析如下：
肿瘤是机体细胞在各种始动与促进因素作用下产生的增生与异常分化所形成的新生物。儿童肿瘤的发病原因至今未明确，但已知，某些因素肿瘤的发病密切相关，如遗传因素、免疫因素和环境因素，目前已知的与遗传因素有关的小儿肿瘤，如肾上腺皮质癌，遗传因素占到50%到80%，建议家长带孩子去医院检查，明确病因，然后对症进行治疗。
一般情况下，儿童颅内肿瘤可能与遗传、先天因素及周围环境因素等有关。
儿童颅内肿瘤的病因和发病机制复杂，病因尚未完全阐明，可能与遗传、先天因素及周围环境因素等有关。1、遗传基因：对于有脑肿瘤家族史的患者，常容易由于某些抑癌基因片段缺失或减少而引发脑肿瘤。2、先天因素:在胚胎发育过程中，一些残留的细胞或组织后期可能逐渐分化形成肿瘤。
儿童出现一些严重的疾病，往往跟遗传和一些基因突变有很大的关系，比如儿童骨肿瘤肯定跟母体还有遗传是有关系的。儿童出现骨肿瘤的情况一般在运动中如果出现疼痛的话容易被发现。
