第一期是卡他期，主要表现为类似感冒的症状，第二期为痉咳期，一般持续2-6周，咳嗽的特点是成串的、接连不断的痉挛性咳嗽后伴一次深长吸气，同时发出一种特殊的高音调鸡啼样吸气样吼声，第三期为恢复期。
通常对症治疗。按呼吸道隔离。保持空气清新，注意营养及良好护理。避免刺激、哭泣而诱发痉咳。在药物上可以选择敏感抗生素治疗。控制感染可以服用一些消炎药来控制，另外不能吃辛辣刺激性食物和生冷食物。需要多喝白开水。如果情况依然没有减轻需要及时去医院进行下一步治疗。
百日咳十天到十四天就能好。患儿需要按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免一切可诱发痉咳的因素。加强护理以预防并发症，注意营养。幼婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。
百日咳治疗起来确实需要一定的时间，也需要对症用药来治疗的，其间孩子出现严重的刺激性干咳，确实非常痛苦，而且做家长的看着也心疼，但是不能心急，百日咳病程比较长，要去医院的传染科。
百日咳会表现为剧烈的咳嗽，由于咳嗽的频率高，非常剧烈，病人往往会咳得面红耳赤，常常会把眼泪鼻涕一起咳出来。由于在发病的时候，吸气过猛，常常会伴有像鸡叫样吸气性吼声，如果未得到有效治疗，一日可以发作三四十次，病情可达数个月。病人往往以夜间发病最为明显，年龄愈小，病情愈重。
成人感染百日咳，主要的临床表现有咳嗽，咳痰同时咳的声音会伴有鸡犬样的吼声，咳嗽剧烈的时候甚至会出现大小便失禁，每一次咳嗽时都会有成串出现咳声，有十几声或几十声。一直到咳嗽有痰液或者咳出胃内容物为止，可以给予一些抗生素，进行隔离，以免病情不能及时得到有效控制，会传染给其他人。
