卵巢囊肿在早孕时可能引起流产，中期妊娠时则易发生卵巢囊肿蒂扭转，晚期妊娠囊肿较大者可导致胎位异常，分娩时可能阻塞产道引起难产。妊娠期盆腔充血，可使肿瘤迅速增大甚至有引起恶变的可能。如果已经怀孕了，那么卵巢囊肿手术在16~24周时进行最为合适。
一侧卵巢囊肿能怀孕。因为囊肿长在一侧卵巢上，而另一侧的卵巢功能正常，怀孕的机理是精子经过宫颈到达子宫直至输卵管与到达这里的卵子结合再回到子宫着床的过程。只要这一过程不会干扰便不会影响正常受孕。所以卵巢只要有一侧有正常功能，没有输卵管方面的疾患，也不存在子宫方面的问题是不会影响受孕的。
通常情况下，怀孕时发现右侧卵巢囊肿，囊肿比较大时需要进行治疗。具体情况分析如下：
卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，患者可能会出现坠胀、下腹部不适、月经异常等症状，如果囊肿比较大，可能会压迫子宫而影响胎儿的发育，或者在胎儿发育过程中可能会发生卵巢囊肿的破裂，因此怀孕时发现右侧卵巢囊肿，囊肿比较大时需要进行治疗。
一般来说卵巢囊肿属于卵巢肿瘤，是女性生殖器官一种常见肿瘤。可能会发于一侧，也可能发于双侧卵巢。卵巢囊肿主要症状表现为：1，白带、月经异常，有的患者表现为功能性子宫出血。2，身体多毛，比如上唇、小腹、胸部等部位部毛发增多。3，卵巢可能会增大。4，可能会不孕。5，可能会肥胖。如果卵巢囊肿小于五厘米，可遵医嘱服用金鸡胶囊、桂枝茯苓胶囊、止痛化癥胶囊等药物治疗。如果卵巢囊肿大于五厘米，可遵医嘱考虑选择宫腹腔镜微创手术。
怀孕初期右侧卵巢囊肿可能是生理性的或者病理性的，需要及时前往医院检查。
妊娠早期发生卵巢囊肿，很可能为妊娠黄体囊肿，发生在妊娠之后。该囊肿为生理性囊肿，通常不超过5厘米。如果在怀孕期间发现了卵巢囊肿，应该及时进行检查和治疗。通过观察无须治疗，然而，必须注意避免剧烈运动。另外在这个过程中还要注意饮食和休息。通常经过2~3个月的观察，即在怀孕三月后，这类囊肿基本可以消失。如果是病理性的肿瘤。应该及时前往医院检查。
女性在孕期出现的右侧卵巢囊肿，如果囊肿的体积不超过4cm，就是生理性囊肿，因为妊娠后雌激素和孕激素的水平出现了变化，所以出现了黄体囊肿或黄素化囊肿。
如果是在妊娠之前就有，但是怀孕后生长速度加快，囊肿体积增大，那么就有可能是病理性的囊肿，这种情况下要根据B超判断囊肿的性质，5cm以上的良性和恶性囊肿都要做手术。
