去专业正规的医院进行检查和治疗，遵医嘱用药。尽量吃清淡一点，要忌生冷和茶。个人的卫生习惯也很重要，内衣勤洗勤换。多用开水烫洗然后放在太阳底下暴晒。保证良好的作息，不要太晚睡觉。
巧克力囊肿的治疗有两种方式，一种是药物控制，效果不好。另一种是手术治疗，能够达到治疗的目的，但是需要选择合适的方式治疗，有些女性需要生育所以只能采取保守治疗方法。
巧克力囊肿晚期可以通过中医医治，中医更平和，没有副作用，平时要注意提高生活质量，减少部分的并发症，饮食上要清淡一些，不要吃过于辛辣的食物，平时还要注意休息，保持良好的心态。
巧克力囊肿应该在中医指导下服用中药治疗。在用药以后需要去医院做B超复查，如果再恢复正常，不需要进一步治疗。如果用药效果不理想，也可以去医院做腹腔镜的微创手术治疗。
巧克力囊肿要手术治疗。巧克力囊肿地看看大小，如果巧克力囊肿特别大，并且症状很明显，短时间内未曾生育，必须马上手术，因为巧克力囊肿影响生育的。要是痛经不是很明显，短时间内没有生育要求，也可以用药物来治疗。巧克力囊肿最根本的治疗方法还是手术会更好一些。手术采用腹腔镜手术，效果很好。术后打针阻断内膜异位症的复发，阻断巧克力囊肿复发可以用一些药。所以，治疗巧克力囊肿的方法就是手术治疗。
