小儿脑炎如果是病毒性的，们要用抗病毒的治疗；如果是细菌，们要抗细菌的治疗；如果真菌，们要抗真菌的治疗。小儿患脑炎，一般的方法是使用一些抗菌抗炎药或抗生素治疗。
治疗自身免疫性脑炎常用的方法是激素治疗法和免疫球蛋白治疗，通过这些抗体的免疫抑制来进行治疗，效果较好。自身免疫性脑炎，主要是由于自身的免疫系统对自身组织发动攻击，导致自己的组织发生损伤，特别是脑组织的损伤，会引起癫痫等一系列的症状。
脑炎是能治疗的，治疗脑炎时炎症恢复不等于神经恢复。所以控制炎症治疗需把握的时间非常关键。如果治疗不当使病情延误，神经受累后如发生缺血导致神经变性在后期几乎不可能再恢复到原来的状态。所以脑炎的治疗关键是早发现，早诊断，早治疗。
脑膜炎常见的表现有发热（可为高热或低热），精神不好，爱睡觉，或爱哭闹，特别有哭声发直的尖叫；头痛、眼神无力凝视发直；呕吐。双眼凝神发呆，或烦躁易怒。头痛呈持续性并加重，呕吐加重并可变为喷射性，逐渐出现嗜睡，还可出现抽搐，病情进一步加重则出现昏迷，频繁抽搐，四肢肌肉松弛、瘫痪。还可出现呼吸不规则，部分死亡。
脑炎首先是要明确病因的，如果是感染的，要找到它究竟是哪种病原微生物进入到脑子里边了；如果是病毒性的，要用抗病毒的治疗；如果是细菌，要抗细菌的治疗；如果真菌，要抗真菌的治疗。总而言之，要明确病原菌的种类，然后给它一种相应的特异的治疗。当然如果明确病因是与自身免疫相关，应该给它相应的免疫治疗，比如丙种球蛋白、激素等。
