一般来说，宝宝肛瘘不会自愈，具体分析如下：
宝宝肛瘘主要是肛周脓肿不能及时的处理，或是经常复发导致的。大多数儿童可以用温生理盐水坐浴，也可以用高锰酸钾稀释液来缓解，但并不能根治，必须进行外科手术。挂线是肛瘘外科最常用的外科方法，它既简便又有效。因此，肛瘘通常不会自行愈合。
在日常生活中，家长应该加强孩子的营养摄入，保持睡眠充足，早睡早起适当参加户外活动，有助于健康成长。
病人应先吃营养丰富的液体食物，然后依照伤口和大便状况，吃易消化、无刺激性的半流或一般食物。有些病人几天不吃东西，因为他们怕大便时伤口疼痛，导致低血糖反应。要了解病人的心情，说明进食的重要性，鼓励病人进食，以利于伤口的恢复。
患有肛门脓肿的一般都可以用多普勒超声检查是否有肛瘘，它是可见的，到三级以上的正规医院做肛肠检查，可以做肛门指检查和肛门内窥镜检查，也可以进行局部彩色多普勒超声和CT检查，找出症状的原因治疗，必要时手术治疗。
多吃润肠通便的果蔬，例如苹果、香蕉、梨等、冬瓜、香蕉、黑芝麻油，蜂蜜水等。为了促进肠蠕动还可喝酸奶，多食含膳食纤维丰富的食物，例如麦麸、豆类等。忌食有刺激性的食物，如酒类，辣椒，海鲜等。
一旦确诊为肛瘘，唯一有效的方法就是手术的，除此之外没有任何保守疗法的，可以选择微创无痛手术的。建议多注意观察目前的情况，可以使用碘伏液进行擦拭消毒。疼痛感会随着时间慢慢减少减小。恢复需要一个多月的时间。
