术后的调理应该从饮食，还有生活作息等方面调理，吃一些，清淡，营养丰富，易消化的食物为主，另外就是多注意卧床休息，不要过早的劳动干活，保持干净，多穿些宽松点棉质的内裤，不要吃生冷辛辣的刺激性食物。
做完巧克力囊肿手术后要注意：首先是按照医生说的按时吃用药物，定期复查肝功能，生活上要注意好好休息一个月，一个月内不能性生活，不能盆浴，不能游泳。不要吃冷冻的食物，不要抽烟喝酒，饮食生活规律，多吃蔬菜水果，适当的吃鱼肉蛋，不要吃用刺激性的食品，少喝咖啡和浓茶等饮料。
应该注意定期作B超复查，防止复发。因为巧克力囊肿手术复发率很高，这种囊肿与周围组织粘连严重，在手术过程中囊液一旦外流，就可以到其他部位种植，引起复发。多吃些蛋白质多的食物，增加体力。
一般手术三个月后再开始备孕。术后要注意不可以随便服用药物，尤其是激素类的药物，可以多吃些高蛋白高营养的食物，增强体质。建议平时注意少吃生冷辛辣刺激性的食物，注意腹部保暖，避免身体受风着凉，不要过度劳累和熬夜。
放松心情，适当散步，一切都会好的。饮食上也可以多补充富含维生素A、维生素C、维生素E的食物，例如：动物肝脏、乳制品、芒果、胡萝卜、枸杞、菠菜猕猴桃、西红柿、草莓、黄瓜、豌豆、牛奶等，特别要多吃野生甲鱼。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成，会引起进行性的痛经，甚至是导致不孕。切除手术以后，禁止同房和盆浴一个月，以免由于过早的同房和盆浴导致引起盆腔的感染，同时还要禁止做重体力活动，饮食清淡才行。
