脑脓肿是细菌感染，通过血脑屏障侵犯脑膜，所以脑脓肿治疗后也可能会有后遗症，比较常见的后遗症是头疼、肢体偏瘫、意识丧失、卧床高热、感染等，所以要长期的使用抗病毒药物治疗，另外要加强护理，尽量防止病人感冒或者是肺炎等。
脑脓肿术后的浮肿在1-2个星期之内就会消失。
如果术后出现了炎症，那么即使是在炎症完全消散之前，也会出现肿胀，直到炎症完全消除，水肿也会随之消散。术后还要配合甘露醇和甘油果糖等消肿、脱水的药物进行治疗，有利于患者的康复，还可以通过口服抗生素来促进病情的好转。因此，建议患者做好术后护理，注意饮食，加强营养。
脑脓肿的手术费用必须视具体情况而定。
脑脓肿的患者一般都选择采取二次或者多次脓肿穿刺抽液等方法来对其病情加以改善。由于对脑脓肿的手术而言，既有单发脓肿，也有多发脓肿，一次脓肿抽吸手术约需3万元~4万元。如果患者患有多发性脑膜脓疱，那么其感染面积可能更大一些，在这种情况下，选择再次手术来治愈或者切除病灶，成本将会更高。而在一些场合，脓肿亦可复发，未必一次根治，此亦为脑脓肿治疗中很重要之因素。另外还有一些人认为在医院里面花费了那么多资金，如果不及时治疗可能对身体造成很大的危害，甚至危及生命。
此外，当地消费水平、患者选择的医院等因素也可能会影响费用多少。
脑脓肿治疗的时间，一般都很长，起码讲抗炎可能要4~6周，经过4~6周的抗炎，才能开展下一步治疗。
还需要根据患者影像学结果来观察其脓肿，是已接近切除，还是已被彻底包埋，之后患者症状是否得到了彻底缓解，进而确定是否需要持续抗炎治疗。
总之其抗感染时间，相对于其他的肺炎、腹腔等感染，治疗时间，大概相对长一点。
脑脓肿手术后需要通过良好生活习惯来防止复发。
脑脓肿可以通过手术治疗、药物治疗和免疫增强等方法治疗。脑脓肿手术后为了预防再次发作，患者应加强适当运动，增强身体素质，预防肺炎、心内膜炎、耳源性感染等感染。在手术后每年或每半年一次随访。如果是穿刺引流，可能会有脓肿包膜等残余物，避免出现炎症性肉芽肿，需要定时进行检查。
