如果是慢性上颌窦炎，想要根治，就是手术治疗。因为慢性上颌窦炎主要的病因就是上颌窦口被炎症堵塞，导致上颌窦内炎症分泌物长期淤积，引起炎症。因此慢性上颌窦炎必须要通过手术来开放上颌窦的开口，让上颌窦内储留的分泌物能够排出。手术才是治疗慢性上颌窦炎的根治的方法，术后的随诊也非常重要。如果手术过后不能按时复诊，可能会导致上颌窦口，再次堵塞，引起慢性上颌窦炎的复发。
严重者采用手术治疗的方法，目的是为了减小鼻腔空间体积和通气量，从而缓解黏膜干燥，常采用的手术方法有前鼻孔闭合术等，症状不太严重的患者用保守治疗的方法，每天冲洗鼻腔，用温热的盐水可起到清洁鼻腔的作用，促进鼻腔黏膜血液扩张以及循环。
萎缩性鼻炎不能治疗好，萎缩性鼻炎尚无特效疗法，宜局部和全身综合治疗，局部治疗可用无菌温热生理盐水鼻腔冲洗脓痂，另外可以采取手术治疗，平时要适当的运动锻炼，增强体质，会对于身体恢复有帮助的。
保守治疗无效者可采用手术治疗，主要目的是缩小鼻腔、减少鼻腔通气量、降低鼻粘膜水分蒸发和减轻粘膜干燥和结痂形成。手术方法：鼻腔外侧壁内移加固定术；前鼻孔缩小术，两侧可分期进行，约1.5年鼻粘膜基本恢复正常后重新开放前鼻孔；医用人工生物陶瓷粘骨膜下埋藏术。
可以用消炎的药物及促进鼻腔黏液稀化、排泄药物治疗，鼻腔用生理盐水清洗，鼻用激素类鼻喷雾剂喷鼻。上颌窦炎是上颌窦黏膜的急、慢性化脓性炎症，伴有多窦炎症或者全组鼻窦炎症，单窦炎症也可存在，单窦炎症以上颌窦炎为多见。
萎缩性鼻炎的治疗，局部可以使用生理盐水冲洗鼻腔，以温生理盐水为主。如果有明显的臭味，可以使用抗菌类滴鼻液，抑制细菌的生长，减少炎症的糜烂，并且有利于上皮的生长。