怀孕卵巢囊肿一般需观察孕十二周，因妊娠后亦可并发黄体囊肿。卵巢囊性肿瘤是一种罕见疾病。黄体囊肿可随妊娠持续而自行变小，甚至消失。若是有恶变的可能时必须立即就医检查。最近若发生良性囊肿伴出血，不是扭转破裂，也不是疑似恶性的。若是子宫内膜异位而引起不孕时必须立即就诊。无论妊娠哪期，均应积极手术，以免耽误病情。卵巢是孕育胎儿最重要的场所之一，而子宫则对卵子起着保护作用。妊娠12周以前，卵巢囊肿手术不容易，由于妊娠12周前胎盘尚未形成，无法产生充足孕激素，无法维持胚胎发育。此时子宫内膜已开始增生并有成熟细胞分泌出大量孕酮，这时若对胎儿已经发生影响，就应及时终止妊娠。
建议孕妇保持良好的心态，主要休息，主要合理饮食。
一般在12周以后就可以自然消失。如果盆腔的超声检查发现，囊肿内容物不均匀，或者是囊壁有乳头状的改变，这有可能是卵巢的恶性肿瘤，可以先做妇科肿瘤标记物进行初步的排查，对于生理性的卵巢囊肿。
卵巢囊肿中医认为主要是由于气血亏虚，湿热邪气结聚所致，一般药物很难治疗好。孕期一般不治疗卵巢囊肿，大多是生理性的黄体囊肿，没有不适不需要处理的。怀孕期有卵巢囊肿不影响胎儿的发育，是需要定期复查的，目前是不需要治疗的。
妊娠发现卵巢囊肿，它的治疗要视孕期迟早而定、包块的尺寸及属性，及病人是否有病症。
早孕期间囊肿嵌在盆腔内，可导致流产，中期妊娠易合并蒂扭转，晚期妊娠，如果肿瘤很大就会引起胎位异常，分娩时会导致肿瘤破裂，如果肿瘤位置偏低，会梗阻产道，造成难产。
早孕并发卵巢囊肿，如在怀孕早期，卵巢囊肿直径在6厘米以下，可多为妊娠所致生理性囊肿，这类通常可在不治疗的情况下自然消退。如果囊肿一直延续到孕中期，未见萎缩，但亦不会增加，亦可在产后再行治疗。如果卵巢囊肿呈扩大趋势，或对恶性可能有较高疑虑者立即手术治疗。若妊娠期卵巢囊肿蒂扭转，还需马上做手术。
一般情况下，怀孕初期卵巢囊肿治疗要根据囊肿的性质和患者的症状决定。
1.如果囊肿直径在5cm以上，一般需要进行手术治疗，避免卵巢囊肿破裂引起急腹症。
2.如果是良性的生理性囊肿，囊肿直径在5cm以下，患者没有明显的临床症状，一般不需要特殊治疗。
日常生活中，应注意个人卫生，饮食清淡，作息规律，多休息，保持良好的心态，注意合理运动，增强自身的体质，有利于身体健康。
怀孕后卵巢囊肿建议疼痛手术进行治疗。
女性在妊娠期间由于盆腔充血，导致卵巢囊肿增大的比较快。如果是在怀孕的时候发现了囊肿，治疗的原则是从妊娠12周开始，到有手术指征的情况下，再继续观察。因为手术会导致流产等并发症，如果是在晚期，可以等到怀孕后再入院。剖宫产的时候，如果发现有卵巢囊肿，一般可以做手术。
