一般来说，宫颈囊肿属于慢性宫颈炎的一种，主要是宫颈表面腺体开口阻塞引起的。如果是单发的小囊肿，而且宫颈脱落细胞学检查无异常改变，通常随诊观察即可，一般不用治疗。如果是宫颈表面多发囊肿，而且有宫颈糜烂，可能会引发腰骶部坠痛、黄脓性白带等症状，一般要治疗。可以遵医嘱选择射频消融术或者是利普刀治疗。术后一个月内通常禁止性生活。
治疗巧克力囊肿的费用大概在几百元到几千元不等，要看病人的病情轻重情况适合什么方案治疗来判断，治疗方案不同治疗费用就会有高有低，病人不能盲目治疗疾病，要是比较轻可以首先采用保守疗法治疗，中药治疗疾病有很多好处，此时花费的费用就在几百元不等，要是比较严重就手术治疗，费用大概要两三千元左右。
巧克力卵巢囊肿可采用的腹腔镜微创术治疗卵巢囊肿卵，手术治疗包括腹腔镜手术和开腹手术，可行囊肿剥离术加卵巢成形术，不需要生育的，行半保守手术，即全子宫切除加患侧附件切除术。
巧克力囊肿炎性囊肿的治疗方法，是要看囊肿的大小来决定怎么治疗的。如果是因为巧克力囊肿导致的不孕不育，那么可以手术切除。也可以到促排卵，增加怀孕几率，具体需要看囊肿的大小来综合治疗。
巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。在临床上，如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。
手术一般有两种方式，开腹和腹腔镜。传统的开腹手术费用较低，3000元-5000元左右，但是创伤大，需要的恢复时间较长；腹腔镜手术创伤小，术后恢复快，费用总计约7000元-9000元左右，但是术后容易引起粘连。
