肛门闭锁的手术根据类型不同，可采取会阴肛门成形，肠造瘘，骶会阴肛门成形，腹会阴肛门成形术，尾路肛门成形术等。如尾路肛门成形术：在会阴部做纵型切口，将游离直肠固定。
肛门闭锁手术要恢复大概是需要在一周左右的时间。经过手术治疗之后是可以根除病症的，不会产生不良的影响。手术之后一定要注意伤口方面的护理，保持伤口的通风和干燥，避免受到感染。及时更换伤口的敷料。
无论是高位还是中位闭锁都需要进行手术治疗，这也是治疗的唯一途径，术后如果排便功能正常就代表手术成功。为了保证安全与效果，术后注意卫生，预防感染，注意规律、合理、清淡饮食，多吃水果和蔬菜，忌食辛辣、刺激、油腻、生冷的食物。增强体育锻炼，提升自己的免疫力。
肛门闭锁主要是由于原始肛发育异常，未形成肛管，导致直肠与外界不通。新生儿先天性肛门闭锁是一种先天性疾病。可以通过手术的方法进行治疗的，尽快带着宝宝去医院检查，根据检查结果，在外科大夫的指导下，采取手术治疗的办法。
对先天性肛门闭锁的治疗，均以手术为主。手术有腹会阴肛门成形，腹会阴肛门成形术，尾路肛门成形术，或低位锁肛：常规消毒，不用局麻也可，只要将会阴部皮肤切开，稍加分离，然后进行扩张，就可以治愈。肛门闭锁的患儿没有排便反射，需要术后不断训练，养成良好的排便习惯。
