怀孕40天进行流产后是否需要清宫要根据流产后复查结果判断。
怀孕40天进行药物流产或人工流产都可以，两者没有本质区别，安全性较高，残留率较低。通常流产后大概两周要复查B超，看宫腔内有无残留。
第一，若有体积小于3cm以下的实性残留或少量液性暗区，血流不丰富的情况，可口服药物促进宫缩，或等来月经，通过月经大部分都可排出体外。
第二，若宫腔内残留无法通过上述方法排出，或残留的体积较大，血流丰富的情况下就需要进行清宫。
流产以后再次清宫的女性恢复时间相对比较长，一般建议6~9个月以后才能怀孕。流产本身对于女性的身体就是一种伤害，而如果流产不全再做了清宫，那么会造成再一次的影响，需要更多的时间修复女性子宫内膜。6~9个月大概会经历7~8次左右的月经。在这种月经次数下，女性的内膜可以反复的增值和分泌经，使得女性子宫内膜得到很大程度的恢复。而且宫颈也能逐步闭合，避免在后期出现宫颈机能不全。
自然流产是否需要清宫要根据复查结果，看子宫的恢复情况或有无残留来决定。
自然流产是指怀孕28周内，孕囊或胎儿自发性地排出宫腔。自然流产也可能流产不完全，建议自然流以大概两个星期到医院复查B超，看子宫的恢复情况，看宫腔内有没有残留。若是有体积较小的实质性残留或少量的液性暗区，可在医生指导下口服药物促进宫缩来帮助排出。若实质性残留较大且血流丰富的情况下，建议进行清宫。
怀孕40天时流产可以选择药流或人流。药流或人流以后是否需要清宫，主要取决于复查结果是否提示有残留。一般情况下，在流产以后一周左右需要做B超，观察患者宫腔内的情况。如果内膜线不完整而且有实质性的残留伴有丰富的血流信号，需要安排清宫手术。如果宫腔内膜线完整，没有实质性的残留，则不需要清宫。建议同房时做好避孕措施，避免意外怀孕。
自然流产清宫后建议半年左右再次怀孕。
孕囊或胎儿自发性排出宫腔即自然流产，没有人工干预，自然流产后复查B超，若宫腔内有残留则需要进行清宫。建议半年后再怀孕。主要原因是：
1、恢复半年左右的子宫内膜功能得到较大的缓解，子宫内膜经过多次的增生、分泌、脱落，子宫内膜功能得到修复。
2、恢复半年左右，女性平复心理，能较好地为再次怀孕做准备。
如果流干净了就不需要清宫，否则就应做清宫手术。此期间主要是，观察流血量的多少，如果出血很多，建议及时清宫，如果出血量少，可以用药物治疗，建议再等两个星期后前往医院做B超检查。