是由于肝内胆管胚胎发育障碍所致，也有一部分是脏器退行性病变所导致的。如果囊肿小于5cm，位于肝脏深部，没有明显的症状，没有出血等问题可以不治疗，定期超声观察就行。如果囊肿大于5cm，位于肝脏表面，有胀痛感等症状，可以考虑超声引导下介入穿刺，抽液。
控制肝囊肿不能吃高脂肪油腻的食物。出现肝囊肿是良性肿瘤，需要定期的进行B超的检查，确定肝囊肿的大小，如果没有影响到肝功能，不需要做任何治疗，也需要进行药物的选择，很大的肝囊肿需要手术切除。
脂肪肝，肝囊肿是两个病，肝囊肿是先天性肝内囊性病变，多数人不用治疗，不用特别注意，偶尔复查就好脂肪肝要注意多锻炼身体，不要吃过于油腻的食物不要饮酒，以吃一些降血脂的药物。
肝囊肿需要到医院检查一下，看囊肿有多大，如果没有超过十厘米，也没有占位病变或者临床症状，不考虑手术治疗，如果超过十厘米有占位效应，同时有临床症状，就需要考虑手术治疗，肝囊肿是一种良性病变，通常不会发生恶性的，建议调整好心态，不要有太大的压力。
一般比较早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿生长部位不影响患者生活，也可以不做处理。
半枝莲熬水治肝囊肿有一定疗效，半枝莲有清热解毒、活血化瘀、消肿止痛、抗癌的作用，常用于阑尾炎、早期肝癌、子宫颈癌、乳腺炎的治疗。药理作用主要有抗菌消炎、祛热止痛和抗癌的作用。
