脑磁共振可检查血管疾病，如脑缺血，脑梗塞，脑出血，血管畸形等；可检查肿瘤病变，如良性囊肿，垂体瘤，脑膜瘤；恶性，胶质瘤，脑转移瘤等；可检查头外伤，如脑挫裂伤等；可检查鼻窦占位，鼻窦炎症。
脑磁共振可检查脑缺血、脑梗死、脑出血、占位性病变等。导致头痛的原因很多。常见原因，如休息不良或紧张性头痛，也可由高血压、脑血栓形成、脑供血不足、脑血管畸形、急性感染引起的发热性疾病如感冒、肺炎等引起。此外，颈椎病也会导致头颈部疼痛。服用特殊药物和遭受创伤也可能引起头痛。
做核磁共振是可以查出来是否有垂体瘤的，脑磁共振对于诊断脑垂体瘤具有非常重要的作用，而且磁共振检查是垂体瘤影像学检查首选的方法。通常通过磁共振检查可以了解肿瘤与海绵窦、脑池、颈内动脉、第三脑室的关系。但是，脑垂体瘤如果合并库欣综合征，有25%-45%的肿瘤在磁共振上不能显示，此刻需要依据症状及相关激素检查予以辅助诊断。
一般来说，磁共振血管造影是一种检查方法，具体如下：
磁共振血管造影是利用电磁波产生身体二维或三维结构的图像的一种检查方法，它能够利用磁共振现象从人体中获得电磁信号，进而重建出人体血管信息。这种方法通常应用于颅颈部颈动脉、椎动脉疾病、颅内血管畸形、血管闭塞、动脉瘤、颅内动静脉畸形等疾病的检查。
在日常生活中，如果患者出现身体不适的症状，应及时就医，在医生的指导下进行治疗。
脑梗死磁共振检查是较先进的检查，成像更清楚，与CT相较而言，脑磁共振能看到更多的信息。一些CT显示不出的异常，但在磁共振上则能显示清楚，例如，局灶性脑皮质发育不良。检查费用高和普及程度低，是磁共振检查的缺点。脑梗塞严重与否要结合核磁共振检查看脑梗塞的n部位面积等结合评估。
