包皮上有小水泡主要采用抗病毒治疗。治疗的目的主要是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程及防止继发感染等。目前的治疗方法尚不能达到彻底清除病毒、消除复发的效果，疼痛者可口服止痛药。
如果手指内有小水泡，需要考虑是不是患有汗疱疹，这种情况可能与过敏、局部感染、遗传、精神因素、免疫紊乱等因素有关。现在许多专家都将这种疾病归为湿疹。在治疗上要避免过度劳累，避免接触刺激性的物品，避免接触香皂、洗衣粉等化学成分。在手上要保持干燥，可以使用干燥、止痒、抗过敏、止痒等药物。可以口服糖皮质激素软膏或炉甘石洗剂。
包皮上出现水泡应该去医院治疗。如果最近曾有过不洁性行为那就考虑是生殖器疱疹，生殖器疱疹潜伏期为2－20天，平均6天。在此潜伏期后，如果出现一些令人不适的症状，如外阴部出现的小水疱可能染上生殖器疱疹。发现可疑的性病症状时，应立即去医院就诊。性病只要及时治疗是可以彻底治疗的。
一般来说，包皮水泡应该根据实际情况来处理。
包皮的主要作用是保护阴茎，它是男性生殖器的一部分，也是指覆盖阴茎龟头的一层皮肤皱襞。包皮水泡考虑可能是感染了疱疹病毒引起的生殖器疱疹，患者需要遵医嘱局部涂抹阿昔洛韦软膏，持续的治疗一到两周。
患者适量增加运动量，锻炼身体，提高免疫力；饮食尽量选择高蛋白的食物；生活要规律，不要熬夜，多休息,保持充足的睡眠。
可能是生殖器疱疹，生殖器疱疹是由于不洁的性接触感染了疱疹病毒引起的一种性传播疾病。如果患者有高危性行为可能性就比较大，需要患者正规医院的皮肤科进一步的检查，明确诊断。另外注意休息，勤洗澡，勤换衣物，不要有性生活。
包皮上面有水泡，还特别的痒，可能是患有生殖器疱疹，和平时性生活不洁有关系，也可能是一些珍珠疹，应该到医院做一下相关检查。可以配合一些止痒的药膏，每天进行清洗，避免同房。
