一般来说，耳朵上真菌感染可以使用药物治疗。
外耳道真菌感染，外耳道会出现豆腐块般的白色分泌物，外耳道和耳廓也会出现红肿、潮湿的情况。可以将外耳道的分泌物用温水清洗，然后用抗菌药物滴在耳廓上，持续使用一个星期，直至所有的外耳道和耳廓症状都消失，并保持干燥。在治疗过程中要避免食用辛辣刺激的食物，辛辣刺激的食物和酒精会刺激外耳道和耳廓粘膜，导致病情反复发作。
耳朵内有霉菌感染时，会感到奇痒难耐。在治疗的时候患者要注意保持耳朵的干净，避免潮湿，可以在耳朵里面滴入硼酸溶液，这样可以起到收敛和抑制渗出的效果。可以外用复方酮康唑乳膏，具有抗真菌的功效。
建议患者不能频繁的抠耳朵，也不能进行摘耳手术，以免造成交叉感染。不能随便买滴耳液，否则会影响到外耳道的正常细菌环境。真菌性外耳道炎首先要确定自身的免疫系统疾病和糖尿病，要及时治疗才能缓解。
耳朵真菌感染用抗真菌的药物，具体内容如下：
如果耳朵真菌感染，可以用美克等抗真菌的药物来治疗，也可以用一些抗真菌的滴耳液，比如水杨酸酒精滴耳液。然而，目前还没有一种药物可以完全治愈耳朵的真菌感染。耳朵真菌感染很容易复发，如果周围的环境比较热，耳朵里经常进水，不及时清洗，长期使用抗生素滴耳液，都会导致耳朵真菌感染的反复发作。
肺部真菌感染属于一种机会性的感染问题。这是因为长期服用广谱抗生素、长期服用激素、长期服用免疫抑制剂，导致免疫力下降，导致肺部真菌感染。肺部真菌感染最常见的是侵袭性肺曲霉病，以干咳、胸痛为主，还伴有咯血。如果是肺部病变的面积比较大，会有气急、喘息、呼吸困难甚至是呼吸衰竭等症状。肺部真菌感染的诊断，需要通过生物学和病理组织学的方法进行，如果发现肺部真菌感染，应立即进行抗真菌治疗，疗程一般在6-12周以上。
耳真菌病一般需要用药治疗一至两周左右的时间，并要注意保护外耳道避免复发。耳朵真菌感染是真菌侵入外耳道内在适宜的条件下繁殖引起的外耳道亚急性或慢性炎性病变，用生理盐水清洗真菌团块及痂皮，用干棉签拭干后，局部涂抗真菌药物。病情严重者要静脉给予抗真菌药物治疗。
也可以出现瘙痒的表现，比如有些脱屑，或者一些分泌物，很普通的抗生素治疗效果没有效果。瘙痒是典型的表现，严重的还会继发细菌感染，出现疼痛流脓的表现，所以一旦发现耳朵有真菌感染，应该及时的到附近的一家医院开药治疗。
