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疼痛期主要表现为牙痛，咽痛和口腔溃疡。
水泡期口腔黏膜的任何区域均可出现簇状小水泡，仿佛针头那么大，尤其在乳磨牙龈缘附近更甚，泡壁通透，粉碎后形成浅表溃疡。溃破后有少量脓性分泌物流出，疼痛难忍。糜烂期时水泡少，而汇集成簇、溃破后则可造成大范围糜烂。恢复期，在口腔溃疡和粘膜充血水肿消退后，复盖一层淡红色或白色假膜。愈合期全程需7~10天，糜烂面渐渐萎缩痊愈。
疱疹性口腔炎的症状表现为，生病时发热达38度到40度1到2天后，齿龈，唇内等各部位口腔粘膜出现单个或成簇的小疱疹，直径2~3mm，周围有红晕，迅速破溃后形成溃疡，有黄白色纤维素性分泌物覆盖，多个溃疡可融合成不规则的大溃疡，有时累及上腭和咽部。
小儿疱疹性口腔炎会出现小点状的黏膜溃疡、疼痛，溃疡面表面乳白色膜覆盖，严重者伴全身症状，如体温升高、乏力、颌下淋巴结肿大等。小儿患疱疹性口腔炎时，还表现为哭闹、拒乳、溜涎、发热等。
疱疹性口腔炎可能会传染。
疱疹性咽峡炎、疱疹性口腔炎、手足口病都是由病毒感染引起的，病毒一般以肠道病毒为主，临床上很难鉴别，需要通过病毒抗体进行鉴别。这种病毒感染引起的疾病具有传染性，需要进行抗病毒治疗和对症治疗。注意口腔卫生，饮食清淡，多喝水，一般一周左右即可痊愈。如果持续高热或者精神状态不佳，建议患者及时就医。
如果是单纯的疱疹性口腔炎，需要及时进行有效的处理，一星期后即可完全康复。
采用一种抗病毒疗法，疱疹性龈口炎是由于单纯疱疹病毒所致的口腔病变，粘膜会产生大量的充血水肿，形成大量的小水泡。如果是破溃的患者，出现了细菌感染，会导致伤口的恢复速度延长，所以要养成良好的生活习惯和饮食习惯，避免食用一些易引起上火的食物。
要经常保持新生儿的口腔卫生，多饮水、禁用刺激性药物，预防口腔炎症，不要让小孩吃一些辣的东西在口腔疱疹期间，要停服牛奶、少吃高蛋白一类的食物，多吃青菜、水果等清热的食物，严格执行消毒隔离制度。
