百日咳需要及时住院治疗，按呼吸道传染病隔离。为保持呼吸道通畅和利于分泌物的排出，痰多时要吸痰，患儿痉咳时注意低头体位，拍背。为防止婴儿突然窒息，夜间易发生，应有专人守护，一旦窒息及时处理，人工呼吸，吸痰，给氧。有呼吸暂停或抽搐，进行气管插管和呼吸道持续正压给氧治疗。口服药物可解除痉挛症状。
打上百白破疫苗，如果是得了百日咳的话，其治疗方式都是一样的，都得用药物来进行处理的，要两个左右的时间，持续时间会比较长一点，要1到2个月左右的时间同时还应该给孩子增强抵抗力。
百日咳的初期是普通上呼吸道感染的症状，但是在初期传染性极强。如果考虑是百日咳，要看从刚开始咳嗽到现在，另外初期过了之后，是经咳期，会剧烈咳嗽、持续咳嗽，咳嗽严重，可能白天黑夜没有缓解。达到经咳期，就要带到医院就诊，查一查血常规、痰培养或细菌培养，看是否有百日咳菌。如果查出来确实有百日咳菌，需要相关对症治疗。
百日咳出血应该要增强儿童抵抗力、免疫力。儿童接触百日咳杆菌，则会导致咳嗽、祛痰、痉挛性咳嗽，并可能出现发热现象，这可以通过肺部ct，也可以通过细菌培养试验确诊，如果试验证实，一般可以选择使用抗生素这类药物至少半个月，并使用药物帮助止咳化痰。
百日咳需要按呼吸道传染病进行隔离。要保持室内安静、空气新鲜和适宜的温度、湿度。要注意营养，阵咳过后再进食。百日咳需要进行药物治疗，要对症使用药物，这样病情才可以好转。如果病情严重的话，则要使用抗生素来治疗。
