碘酒有强大的杀灭病原体作用，它可以使病原体的蛋白质发生变性。碘酒可以杀灭细菌、真菌、病毒、阿米巴原虫等，可用来治疗许多细菌性、真菌性、病毒性等皮肤病。碘酒因它具有氧化破坏病原体原浆蛋白的活性基因，并与蛋白质的氨基结合而使其变性沉淀，故具有强大的杀菌作用。
碘酒没有杀灭寄生虫的作用，不能治疗阴虱。
阴虱是一种寄生在人体毛发的寄生虫，主要是长在阴部以及肛周围。患者在使用药物的同时，需要先将阴毛剔除干净，然后再将内衣内裤和床上用品都用热水烫洗，且保持卫生清洁，用清水清洗生殖器，然后使用药物进行局部涂抹。
碘伏和医用碘酒不是一样的。
碘伏和医用碘酒有区别。碘伏的碘含量仅为0.5%，而医药碘酒浓度为2%-3%。碘伏和医用碘酒一般都用来做常规消毒，但使用医用碘酒时需注意，其会灼烧黏膜，因此不能用作对黏膜进行消毒，否则会导致皮肤溃破。相比起来，碘伏应用是更加广泛的。如果患者拿不准该用什么消毒，建议到正规医院请医生进行操作，避免盲目操作对自身造成伤害。
碘酊具有强大的杀菌作用，一般取2%浓度用于注射部位皮肤消毒或早期疖肿的消炎，但有较强的刺激性、腐蚀性，所以用于皮肤消毒后应以70%酒精擦拭脱碘，且禁用于黏膜或伤口内消毒，否则会引起剧痛和红肿。因此碘酊脱碘的原因就是碘酊有较强的刺激性、腐蚀性，并且有些患者对碘过敏，用后及时脱碘可以防止碘造成过敏。
临床工作之中经常使用的消毒药物，包括碘伏和酒精，碘酒是碘的酒精溶液，是可以用来进行伤口和创面消毒的。但如果碘的浓度过高，会对伤口的局部皮肤导致刺激性过大，所以就不利于伤口愈合。但是也可以在碘酒消毒后，用少量的酒精进行脱碘，并且要保持创面干燥，无菌敷料包扎，避免敷料受水等其他外界因素的污染，定期进行换药。
