硫酸氨基葡萄糖胶囊可以提高软骨细胞的修复能力，从而就可以抑制损害关节软骨的酶，防止细胞的氧化，促进软骨的修复和重建从而减轻疼痛，改善关节的功能，还可以延缓关节性疾病的发展，所以主要用于缓解关节疼痛，改善关节功能，临床上主要用于骨关节炎。
硫酸氨基葡萄糖胶囊的作用是增强软骨细胞的再生能力，并阻止其生成过氧化自由基。禁忌是软骨退化严重禁止使用。氨基葡萄糖是一种天然的氨基单糖，可以合成蛋白多糖来修补软骨，对关节的退行性病变有一定的治疗作用。因此可以用于膝关节炎、手腕关节炎、颈椎炎等关节部位的疾病。如果是软骨关节退化严重，或者是器官功能不全，建议在医生的建议下服用。
硫酸氨基葡萄糖的主要成份为硫酸氨基葡萄糖，使用于全身各个部位的骨关节炎，如膝关节、髋关节以及脊柱、腕、手和踝关节等，副作用多见于罕有轻度的胃肠道不适，如恶心、便秘、腹胀和腹泻。
没有区别，二者其实都主要用于治疗和预防全身各种关节的骨性关节炎，包括膝关节、肩关节、髋关节、脊柱、手腕、颈部和脊椎，踝关节等部位，可缓解和消除骨性关节炎的疼痛、肿胀等症状，改善关节的活动功能。
最基础的区别就是硫酸软骨素是单方药物，而氨糖软骨素是氨基葡萄糖和硫酸软骨素复合而成的复方药物。其次硫酸软骨素可以和水分子结合，滋润关节部位，主要作用是促进关节软骨再生。而氨糖软骨素中氨基葡萄糖可以保持关节软骨的代谢平衡、促进胶原蛋白的合成、修复损伤的关节软骨，氨糖软骨素主要作用就是改善关节问题。
硫酸氨基葡萄糖主要治疗一些风湿，骨质增生，或者说是一些关节疼痛，硫酸氨基葡萄糖可刺激软骨细胞产生具有正常多聚体结构的糖蛋白，防止皮质激素及某些非甾体类抗炎药对软骨细胞的损害。
