一般情况下，小孩吃肠虫清有副作用。
孩吃肠虫清大多没有什么严重的不良反应，少数病例有轻度的头痛、头晕、恶心、呕吐、腹泻、口干、乏力等不良反应，是不需要处理的，它是可以自行的消失的，一般不需要特殊治疗，家长平时需要注意宝宝的饮食，均衡营养，同时还需适当带宝宝出门活动，能够促进宝宝身体的新陈代谢，让宝宝更快的生长发育。
肠虫清是吞服还是嚼碎效果都是一样的。肠虫清属于一种广谱的驱虫新药，具有杀虫谱广泛，杀虫作用强的特点。尤其是对线虫、血吸虫、绦虫有高度活性，同时，对虫卵发育有较强的抑制作用。本药的服药时间和方法：在空腹服药比较好，因为空腹时候服药吸收最好，药物在肠道内的浓度会更高一些，因此药效发挥最好。另外，因为蛲虫病自身容易重复感染，所以在治疗两周后应该重复治疗一次。建议吃完肠虫清后多吃一些新鲜水果，少吃油腻食物，以更好的提高疗效。
中药晒干进行烘烤最后打粉就好了磨成粉了。磨成粉后煎药的时间会缩短，很难控制，而且都是碎末，得用纱布包起来煎。如果直接吃的话用量就得改了。直接加水在榨汁机里搅。还有这些药是干净的，没有泥沙。
所有的打虫药都是弱毒性，没有确诊有虫前不要轻易服用。
小孩肚子疼的原因可能是：肠痉挛、肠系膜淋巴结炎等。建议及时就医明确病因再用药治疗。着凉腹痛是一过性的，腹子内有气，轻轻拍动有鼓声。建议检查腹部浅表超声，看肠系膜淋巴结是否异常。不让孩子脚部、腹部着凉，不吃生冷的食物，贴暖气贴。检查粪便，若有虫卵再打虫。
中药是一种非常苦的药材。被磨成药粉的中药直接用水冲泡，然后服下就可以了。如果怕中药的苦味的情况下，可以准备一点点白糖，还可以准备一些糖果。不用担心，这种做法对中药的药效是没有影响的。但是不可以直接把糖放进中药当中的。
一般情况下，不管是否有肠道寄生虫，正常使用肠虫清，对人体几乎没有什么影响，会有一点点腹痛，大便性状还可能出现一点不正常，应该注意观察，通常两天后都不会有什么毛病。如果发现孩子的肚子里有虫体，一定要及时进行驱虫治疗。最近应加强对小孩子大便中有无蛔虫卵或蛔虫的观察。
此外，小孩吃肠虫清后应该合理饮食，避免进食油腻、辛辣的食物。
