药流三天后孕囊还没完全排出需要去医院清宫治疗，以免出血过多。流产后要注意休息，不要吃辛辣刺激的食物，不要过度活动，注意外阴卫生，尽早去医院做清宫术，术后在医生指导下进行药物治疗。
药物流产需要在怀孕七周以内，不超过49天是可以做药物流产的，并且效果比较好。如果孕囊没有排出，需要进行彩超检查。如果孕囊确实还在宫腔内，可能是药物清除不了，清除不了也是需要做手术治疗的。
孕囊没有排出来，可以再做清宫。孕囊没有排出来，是药物流产失败，不用再继续口服药物了，可以直接再做清宫。清宫和人工流产是差不多的，对子宫及内膜有一定的创伤。注意观察阴道出血情况，注意保暖避免着凉，合理饮食，忌盆浴，忌性生活，注意外阴卫生。
一般情况下，药流后平时流血量逐渐下降，血块通常仅于药流前3天排出，3天后通常仅有少量褐色血液。药流后第5天应注意观察是否有出血现象，如果有出血现象，要及时去医院检查治疗，以免造成不必要的麻烦和痛苦。建议服用益母草胶囊或葆宫止血颗粒以促进子宫收缩，使血液回流到宫腔。如果服用药物后为缓解，需要及时清宫。
孕囊排出后肚子阵痛有必要再做个复检，查看一下宫内情况，如果残留物较大的话，还是需要考虑清宫的。轻微的话可以服用治疗这方面得药物促进这些残留排除。如果疼痛过一阵的话，也不太正常。可能与感染有关系。
