卵巢囊肿一般不能吃药进行治疗，一般可以通过手术进行治疗。激素水平异常可能会导致卵巢囊肿，如果卵巢囊肿较小，一般不会导致女性出现明显不适症状，此时吃药不能治疗卵巢囊肿，所以一般可以不进行特殊治疗。如果卵巢囊肿较大，可能会影响正常怀孕，此时药物对于卵巢囊肿的治疗作用不明显，需要及时进行手术治疗，以切除卵巢囊肿。
如果患有卵巢囊肿出现小腹突然的非常疼痛，可能是卵巢囊肿扭转引起的，大多数卵巢囊肿不会引起小腹疼痛，但是如果出现囊肿较大出现扭转，囊肿缺血坏死会出现剧烈疼痛，需要到医院做进一步检查，如果是卵巢囊肿扭转，一定要及时就医，避免耽误治疗时机，造成更加严重的后果。
早孕有轻微的腹痛，是常见的生理现象。所以有一些孕妇早孕之后，会出现像来月经这样的隐痛。卵巢囊肿分为生理性的黄素囊肿和一些病理性的囊肿，比如卵巢的巧克力囊肿等。卵巢生理性黄素囊肿有时候可能会发生黄体破裂，造成急腹症。如果腹腔出血较多，疼痛比较严重，需要及时住院行手术治疗。
卵巢囊肿当然会肚子疼了。卵巢囊肿分为生理性的黄素囊肿和一些病理性的囊肿，比如卵巢的巧克力囊肿等。卵巢生理性黄素囊肿有时候可能会发生黄体破裂，造成急腹症。如果腹腔出血较多，疼痛比较严重，需要及时住院行手术治疗。卵巢巧克力囊肿也会发生痛经以及肚子的疼痛等，如果巧克力囊肿破裂，也会发生腹痛严重甚至囊液种植，造成子宫以及盆壁的内膜异位灶，造成痛经的加重。
如果是没有检查，怀疑是不准确的，一般肚子痛，腰酸，最常见的就是盆腔炎，很多盆腔炎都是反复的阴道炎引起的。不管是哪一种，去正规的公立医院看一下，如果经常这样，转变为慢性的，看起来更麻烦，所以还是听医生的。
一般情况下，有卵巢囊肿的患者如果出现隐隐作痛不建议自行服药，以免造成用药不当，影响身体恢复。有卵巢囊肿的患者如果出现肚子隐隐作疼，一般是由于卵巢囊肿比较大，对周围的脏器有所压迫导致血液流通不畅造成的，患者应该做B超检查，确认卵巢囊肿的大小，如果超过5厘米的话是建议进行手术治疗的，以免延误病情的诊治。