肛周脓肿自行破溃后需要及时去肛肠科进行处理，需要及时进行手术引流，争取把脓液排干净，这样愈合的快，也可以防止肛瘘的产生。手术后必须保持大便通畅，多吃水果蔬菜喝香油，避免大便用力，坐浴，每天三次，每次十分钟。
肛周脓肿破溃是件好事，这样以来脓水可自行流出，防止其象肛周深部发展，另外，可以减轻自身疼痛或感染，尽量是能保持引流通常一段时间，但大部分肛周脓肿后期要形成肛瘘的，建议手术切除肛瘘。
婴儿肛周脓肿术后流脓恢复需要4到6周，部位的手术恢复相对来说比正常部位慢，每天换药一次，不吃辛辣刺激性食物，促进恢复，肛周脓肿的治疗周期较长，建议休息一个月左右，手术后必须积极治疗伤口，换药要注意。视脓肿腔情况而定，应定期进行坐浴治疗，换药和油纱布应持续到脓肿腔变浅基本消失。
肛周脓肿必须手术治疗，不然将成为一个严重的问题。同时，可以选择无痛微创手术治疗。恢复期很短。同时，手术后易于护理。如果肛周脓肿手术后疼痛，可以适当使用一些止痛药，同时也可以混合一些胃保护药。肛周脓肿手术后，应注意换药治疗，定期坐浴治疗，直至脓肿浅部基本消失。
肛周脓肿早期可以用抗生素来控制进一步发展，但是如果已经形成脓肿了那就不是吃药的问题了，那就需要手术治疗了。可以做肛门镜检查，以明确具体诊断，方便进一步治疗。
肛周脓肿术后需要连续换药治疗一个月，完全恢复两个月。因为术后伤口容易被粪便污染，这样会影响创面的愈合。其术后恢复时间主要是跟创面的大小以及术后换药有直接的关系。