生理性尿分叉，主要是由于尿道或尿道开口处临时有阻塞，男性射精后因部分精液还残存在尿道中，海绵体充血尚未完全消失，导致尿流不畅。病理性尿分叉是经常的或长期的排尿分叉，很可能与一些疾病相关。长期尿分叉大多由于后尿道或尿道口处狭窄，或因慢性炎症后形成瘢痕，导致尿液不能通畅排出。急性尿道炎、前列腺炎期间，由于尿道充血、肿胀、分泌物增多，可影响尿流的通畅而出现分叉现象。
尿分叉的原因与尿道粘膜不光滑（如炎症、新生物）、尿道存在分泌物、尿道口不规则等因素有关，可以见于前列腺炎、前列腺增生，尿道炎、疤痕、尿道口异常等。所以引起了尿道尿液动力学发生了改变而导致尿分叉。
尿分叉是因为尿道阻力的增加导致，另外还有生理因素也会导致尿分叉，比如早起排尿时由于膀胱聚集大量尿液，排尿时尿道外口可能暂时闭合引起排尿分叉，这是一种正常的生理现象，不需要治疗，常见的男性患者就是前列腺炎、前列腺增生，由于前列腺炎导致的尿道水肿，可以引起尿道阻力增加，引起排尿分叉。
尿液尿分叉是因为急性尿路感染或者是前列腺炎疾病，炎症感染尿道，从而出现尿液分叉，临床上如果排尿次数增多，需要到当地医院去进行面诊，到医院做一个前列腺炎或者前列腺彩超确诊一下。
女生的尿分叉有很多情况是生理性原因，夜里憋尿，一夜没有排尿，膀胱内的压力高，排尿时压力大，导致尿道外口形态改变，导致排尿时尿分叉。另外女性的尿道口与阴道口距离比较近，分泌物可以堵塞在尿道口周围。排尿的时候导致尿分叉。或是女性的膀胱颈增生，导致排尿无力会尿分叉。
