复发性口腔溃疡发病原因除了口腔感染以外，还与自身免疫功能紊乱有关，所以治疗除了控制感染，还应该服用中药调理免疫功能，常用炙甘草汤加减治疗。中西医结合治疗，合理科学饮食，补充维生素和微量元素，注意口腔卫生，养成良好的生活习惯。
治疗复发性口腔溃疡采取全方位数字自动分析仪，口腔，细菌培养，免疫检查这些来明确病因，针对性的治疗的，主要是因为免疫失衡引起的，要从中医角度去提升自身免疫力，先要找准病因，然后再针对性对因施治。
口腔溃疡的问题，在西医的角度上，考虑到是因为维生素的缺乏引起的，但补充维生素的治疗效果不佳，所以建议中药调理为基本。可与西药联合使用，控制症状能更快的康复。
是用庆大霉素注射液含漱，由于本药没有讨厌的口味，仅仅有略微有一点酸味，且口服无吸收。通过中药调理来增强体质，能从根本上消除复发，以治本为主，疗效最好，需更高层次中医调理。中药调理即能解决溃疡上火"的问题，还能调理和改善体质，彻底改变这类易上火体质。
反复发作的口腔溃疡这类溃疡在发病过程中，口腔可有大小不等椭圆形或圆形创口，且中部凹陷，被假膜覆盖，同时被红色晕带所包围，病人此时大都有较明显灼痛感，精神状态大多不太好。
在治疗上需要采用药物进行对症处理。反复发作的口腔溃疡是一种自限性疾病，病情通常持续约1周至半月后消失，在这段时间里，饮食是必须重视的。在日常护理过程中，应该根据自身情况和具体症状选择适当方法进行治疗。努力减少局部刺激，帮助溃疡自动痊愈。
病人发生复发性口腔溃疡其原因较为复杂，至今均未完全清楚其发病原因。
但往往认为这是由多因素、共同作用所致，即复发性口腔溃疡为多因素疾病。很可能由遗传基因和免疫功能异常及社会环境因素三块因素综合造成。当然病人的精神压力太大、病人长期吸烟、病人口腔卫生差、病人饮食不均等也都是可以造成的。
建议在日常注意口腔护理，定期刷牙，减少口腔溃疡的发生。
对于口腔溃疡，中医要对症治疗，调节免疫力平衡，提高机体自身免疫力是治疗疾病的关键所在。中西医结合辨证施治依据个人体质所独特配制的纯中药方剂，通过内外兼治，提高免疫力，筑起人体的防预屏障，从而有效的抵御细菌和病毒侵入，发挥对细胞免疫功能的调节作用，增加免疫球蛋白的数量，平衡五脏六腑的功能，提高机体自身免疫力，从源根上有效治疗口腔溃疡。
